255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3191 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  100 
 
 
280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  91.07 
 
 
279 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  91.07 
 
 
279 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  90.36 
 
 
279 aa  497  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  90.71 
 
 
280 aa  495  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  83.93 
 
 
280 aa  474  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  89.24 
 
 
250 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  82.14 
 
 
280 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  75.71 
 
 
280 aa  454  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  81.07 
 
 
280 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  76.43 
 
 
280 aa  447  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  79.64 
 
 
280 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  78.57 
 
 
280 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  42.22 
 
 
278 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  41.22 
 
 
280 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  41.97 
 
 
278 aa  228  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  37.02 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  37.4 
 
 
278 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  37.4 
 
 
278 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  36.05 
 
 
277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  32.74 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  37.28 
 
 
278 aa  139  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  32.33 
 
 
270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  36.36 
 
 
287 aa  136  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  31.73 
 
 
270 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  31.37 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  32 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  32 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  31.2 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  31.22 
 
 
287 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  32.54 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  32.86 
 
 
430 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
283 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  29.13 
 
 
406 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  26.89 
 
 
399 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  29.19 
 
 
410 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  29.13 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 
409 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 
285 aa  92  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  29.28 
 
 
413 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 
544 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  30.67 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  30.67 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  30.67 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 
282 aa  79  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  30.25 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  27.8 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0722  hypothetical protein  27.4 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.13 
 
 
655 aa  75.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  29.67 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  29.01 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  24.26 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  30.26 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  29.45 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  22.54 
 
 
283 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.52 
 
 
280 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  24.88 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.5 
 
 
287 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.67 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  24.56 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  28.71 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  27.05 
 
 
730 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003755  predicted signal transduction protein  24.66 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  31.97 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02629  hypothetical protein  24.66 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  27.83 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  27.14 
 
 
283 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  30.19 
 
 
408 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  24.54 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  27.09 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  25.12 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 
299 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  31.52 
 
 
456 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.67 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  24.88 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.13 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2035  hypothetical protein  23.18 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.7 
 
 
284 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.02 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 
353 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1388  putative signal transduction protein  22.66 
 
 
282 aa  65.5  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.17 
 
 
718 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 
300 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2488  putative signal transduction protein  26.09 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  27.4 
 
 
415 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
703 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  33.57 
 
 
509 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  22.86 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.61 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 
455 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>