299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4229 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4229  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3963  hypothetical protein  94.87 
 
 		 273 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  61.9 
 
 		 273 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1462  putative signal transduction protein  56.32 
 
 		 278 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54490  hypothetical protein  55.96 
 
 		 278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.684818 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4762  hypothetical protein  55.6 
 
 		 278 aa  324  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  56.99 
 
 		 270 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1062  putative signal transduction protein  57.35 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1422  putative signal transduction protein  55.88 
 
 		 270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4299  putative signal transduction protein  55.88 
 
 		 270 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.729715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2256  putative signal transduction protein  44.04 
 
 		 278 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.446678  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2268  putative signal transduction protein  46.21 
 
 		 277 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  39 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  35.27 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03445  putative signal transduction protein  34.39 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  31.99 
 
 		 406 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  31.68 
 
 		 271 aa  142  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1203  hypothetical protein  33.04 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.897132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1005  putative signal transduction protein  33.18 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  32.2 
 
 		 409 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  29.31 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1069  putative signal transduction protein  34.55 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3341  putative signal transduction protein  33.18 
 
 		 280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1038  metal dependent phosphohydrolase  30.12 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.227118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2801  putative signal transduction protein  33.18 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3010  putative signal transduction protein  31.14 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311361  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1065  putative signal transduction protein  34.55 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1137  putative signal transduction protein  34.55 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.779758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  34.02 
 
 		 283 aa  132  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1023  putative signal transduction protein  32.72 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1046  hypothetical protein  31.11 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1176  putative signal transduction protein  32.26 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3191  putative signal transduction protein  32.26 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3335  putative signal transduction protein  32.26 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3197  putative signal transduction protein  32.26 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3511  putative signal transduction protein  31.69 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2782  putative signal transduction protein  31.34 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1254  hypothetical protein  31.73 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2414  cyclic nucleotide-binding protein  28.99 
 
 		 410 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172286  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  30.09 
 
 		 399 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1380  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.983267  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1964  putative signal transduction protein  28.97 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.594369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  31.22 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  27.89 
 
 		 718 aa  85.5  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  29.67 
 
 		 278 aa  82  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  28.26 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  23.23 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  30.93 
 
 		 724 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  28.32 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.02 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  25.65 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  24.38 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  30.65 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.57 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  27.69 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  25.35 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.66 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  27.81 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  25.88 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  30.16 
 
 		 512 aa  72.4  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  28.73 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.51 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  29.26 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  28.06 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 		 544 aa  70.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 703 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.65 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6123  hypothetical protein  25.74 
 
 		 469 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  25.6 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.75 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  29.11 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  28.11 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  26.78 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  27.83 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.44 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2028  putative signal transduction protein  25.97 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  23.04 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2511  putative signal transduction protein  24.76 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.118204  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.92 
 
 		 730 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 		 425 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 455 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.39 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>