164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1784 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1784  putative signal transduction protein  100 
 
 		 285 aa  579  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0555  putative signal transduction protein  36.43 
 
 		 427 aa  162  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  32 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1494  putative signal transduction protein  29.56 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000467466  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 281 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  27.57 
 
 		 293 aa  85.5  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.43 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  23.39 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.29 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  23.87 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  26.57 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  22.17 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.44 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  25.23 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  24.24 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  24.11 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.59 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  23.81 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 397 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  26.18 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  21.29 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.76 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  23.65 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  25.6 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  25.83 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  23.3 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  24.55 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.68 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  22 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  24.88 
 
 		 517 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  23.76 
 
 		 912 aa  62.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  21.9 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  25.49 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  24.23 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  20.6 
 
 		 282 aa  62  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  25.49 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  21.39 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  24.32 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  26.75 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  24.07 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  22.39 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  26.24 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  22.8 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.48 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  22.34 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  22.46 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  23.86 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  21.34 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  23.71 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  22.75 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  24.26 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  24.75 
 
 		 716 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  23.84 
 
 		 371 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  21.61 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  23.4 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.25 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 440 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  24.66 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  25 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2489  diguanylate cyclase  26 
 
 		 836 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.56 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  24.43 
 
 		 496 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0704  hypothetical protein  23.58 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.670441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  23.35 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  21.98 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  20.94 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  21.5 
 
 		 412 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  23.32 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  24.55 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  21.21 
 
 		 289 aa  53.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  26.09 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  24.26 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  24.26 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.6 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0980  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.297329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 293 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  23.74 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  22.37 
 
 		 427 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  33.67 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  21.53 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  25 
 
 		 468 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  21.53 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  22.39 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  21.8 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3872  Metal-dependent hydrolase HDOD  21.49 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.383725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  19.74 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.6 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  23.83 
 
 		 358 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>