60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0555 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0555  putative signal transduction protein  100 
 
 		 427 aa  884    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1784  putative signal transduction protein  36.43 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 272 aa  100  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1494  putative signal transduction protein  23.46 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000467466  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.86 
 
 		 297 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  29.31 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  22.99 
 
 		 282 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.8 
 
 		 730 aa  60.5  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.58 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  21.96 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  23.08 
 
 		 299 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  22.27 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  21.82 
 
 		 284 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.87 
 
 		 298 aa  57  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  21.1 
 
 		 288 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  22.67 
 
 		 284 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  24.76 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  20.63 
 
 		 283 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0410  diguanylate cyclase  24.82 
 
 		 657 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  20.63 
 
 		 283 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  24.86 
 
 		 397 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  25.29 
 
 		 517 aa  53.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.86 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  24.07 
 
 		 304 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  24.76 
 
 		 293 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  24 
 
 		 283 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  22.95 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.53 
 
 		 303 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  22.27 
 
 		 299 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  22.84 
 
 		 281 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  22.56 
 
 		 279 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  24.23 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  24.5 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  23.08 
 
 		 288 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  20.2 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  19.55 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  22.65 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  23.46 
 
 		 254 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  22.93 
 
 		 718 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  21.54 
 
 		 281 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  22.77 
 
 		 716 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  19.78 
 
 		 290 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  23.73 
 
 		 280 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  21.08 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  23.23 
 
 		 282 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  21.03 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  22.48 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  21.39 
 
 		 274 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  19.8 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  19.93 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  20.07 
 
 		 297 aa  45.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  21.9 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  22.92 
 
 		 287 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  26.53 
 
 		 273 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  35.9 
 
 		 661 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.49 
 
 		 297 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>