172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1209 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  89.06 
 
 		 466 aa  862    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  95.08 
 
 		 488 aa  963    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  95.29 
 
 		 488 aa  964    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  81.06 
 
 		 491 aa  831    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  100 
 
 		 488 aa  1008    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  80.86 
 
 		 491 aa  830    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  81.26 
 
 		 491 aa  831    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  81.52 
 
 		 451 aa  712    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  60.53 
 
 		 488 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  60.08 
 
 		 494 aa  584  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  58.08 
 
 		 489 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  57.79 
 
 		 493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  59.46 
 
 		 484 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  56.85 
 
 		 482 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  55.97 
 
 		 491 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  32.14 
 
 		 486 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  32.49 
 
 		 477 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  30.98 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 476 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  29.02 
 
 		 470 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  24.9 
 
 		 790 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  24.85 
 
 		 546 aa  106  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  23.29 
 
 		 790 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  24.4 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  22.49 
 
 		 824 aa  90.9  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  30.62 
 
 		 791 aa  90.1  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  22.49 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  21.86 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  26.24 
 
 		 485 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  24.77 
 
 		 582 aa  73.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  26.62 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.87 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  28.02 
 
 		 484 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  20.39 
 
 		 477 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  26.7 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  26.7 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  26.7 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  23.6 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  23.6 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  23.6 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  24.9 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.94 
 
 		 287 aa  65.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  22.52 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  22.52 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  24.76 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  22.52 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.32 
 
 		 517 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  24.88 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  22.37 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  27.43 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.92 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  22.27 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 703 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  26.19 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  34.97 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  25.37 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.34 
 
 		 280 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  25.37 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  24.51 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  26.44 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  21.76 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.96 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  23.45 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  25.4 
 
 		 718 aa  60.1  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.2 
 
 		 297 aa  59.7  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  21.86 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  21.72 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  29.25 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  29.25 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.34 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  24.34 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  21.74 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  22.8 
 
 		 716 aa  57.4  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  24.43 
 
 		 293 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  22.89 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.43 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  23.83 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  24.02 
 
 		 279 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1199  putative signal transduction protein  25.11 
 
 		 269 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000261595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  24.52 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25.12 
 
 		 730 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 280 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  21.09 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  21.05 
 
 		 274 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.97 
 
 		 297 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  24.77 
 
 		 280 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 		 283 aa  53.9  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.56 
 
 		 283 aa  53.9  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.88 
 
 		 287 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.53 
 
 		 284 aa  54.3  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  25.97 
 
 		 634 aa  53.5  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  22.84 
 
 		 297 aa  53.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.53 
 
 		 634 aa  53.5  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  25.26 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>