265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1569 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  100 
 
 		 283 aa  540  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2176  putative signal transduction protein  41.9 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.173255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 280 aa  99  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  28.57 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  30.95 
 
 		 280 aa  93.6  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  33.82 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  32.02 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  32.67 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1012  putative signal transduction protein  34.98 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  26.7 
 
 		 305 aa  89  7e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 291 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  32.32 
 
 		 517 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  33.51 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  28.37 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  30.85 
 
 		 283 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  31.09 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  30.32 
 
 		 283 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0854  putative signal transduction protein  38.12 
 
 		 223 aa  85.9  6e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  30.96 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  30.91 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  33.7 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  33.66 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  30.69 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  28.26 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.63 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  33.51 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  27.83 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  27.83 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.64 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.26 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.26 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.26 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.26 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  31.55 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  30.81 
 
 		 650 aa  79.7  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  33.84 
 
 		 397 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  32.82 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  33.13 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  29.55 
 
 		 407 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  29.85 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 661 aa  77  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  30.6 
 
 		 634 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  32.14 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  31.61 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  32.14 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  28.49 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  31.14 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  29.73 
 
 		 505 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  28.9 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.48 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  31.98 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.21 
 
 		 634 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  29.07 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  29.67 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  31.31 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  29.07 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  27.96 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  29.07 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.61 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  26.26 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0691  signal transduction protein  30.73 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  30.85 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  27.17 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  32.54 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  27.91 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0413  hypothetical protein  27.91 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4762  hypothetical protein  27.33 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.08639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  30.89 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  27.34 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  31.63 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  32.23 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  30.99 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.7 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  24.43 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  30.54 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  26.61 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  34.1 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  24.42 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2489  diguanylate cyclase  29.5 
 
 		 836 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  31.67 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  28.07 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  25.82 
 
 		 456 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>