275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1977 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  100 
 
 		 305 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  39.27 
 
 		 438 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  31.5 
 
 		 317 aa  105  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 		 280 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  26.59 
 
 		 412 aa  96.7  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 		 282 aa  89  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  31.96 
 
 		 397 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 297 aa  85.9  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  27.62 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2725  putative signal transduction protein  34.17 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  30.61 
 
 		 505 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 397 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  27.27 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  27.46 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  28.65 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  29.11 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  31.31 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  27.23 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.66 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  23.15 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  24.91 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  25.57 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  25.32 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  23.92 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  27.84 
 
 		 415 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.9 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  24.66 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  25.67 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  29.38 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  32.16 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.11 
 
 		 274 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.1 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 		 340 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  22.82 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.79 
 
 		 274 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 275 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  26.2 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  25.91 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  26.63 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 		 790 aa  70.1  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  22.32 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  25.13 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 		 425 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3751  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4397  putative signal transduction protein  28.71 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.81 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  30.43 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  25.45 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  24.48 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  26.92 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  26.7 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0312  putative signal transduction protein  29.63 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.52 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  27.75 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  22.92 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.95 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  23.08 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  24.16 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.7 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  24.75 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  24.74 
 
 		 650 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  25.77 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.04 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  24.73 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  24.73 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  29.67 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  26.5 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  28.8 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  23.08 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  26.55 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.05 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  24.86 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  23.56 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  23.62 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  31.98 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  26.94 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  27.45 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.27 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>