247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0716 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0716  putative signal transduction protein  100 
 
 
276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  34.18 
 
 
280 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.91 
 
 
524 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  40.09 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2713  putative signal transduction protein  39.37 
 
 
278 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.694333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  38.46 
 
 
290 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  32.51 
 
 
326 aa  112  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  32.04 
 
 
289 aa  94  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.21 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  27.94 
 
 
415 aa  87  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  27.93 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.73 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  27.04 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  27.04 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25.2 
 
 
283 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  29.44 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  24.52 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  23.47 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.81 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.7 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  29.95 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.26 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  27.78 
 
 
373 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  29.78 
 
 
378 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  28.8 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  29.06 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  25.71 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 
287 aa  73.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.98 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  21.47 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.28 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  26.7 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.26 
 
 
283 aa  72  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.14 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
297 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  26.25 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.77 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  28.64 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  29.58 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  29.79 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  29.58 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  27.89 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  25.1 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  26.87 
 
 
650 aa  70.5  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.38 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2279  HD domain-containing protein  25.67 
 
 
496 aa  70.1  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.911233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  27.23 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1012  putative signal transduction protein  28.24 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  26.84 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2040  hypothetical protein  26.63 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.414414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1039  putative signal transduction protein  28.19 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.88 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.86 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  24.6 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1923  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 
395 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 
298 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
285 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1838  metal dependent phosphohydrolase  26.7 
 
 
395 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.38 
 
 
517 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3372  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
295 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  25.45 
 
 
465 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
406 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  27.36 
 
 
353 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  22.41 
 
 
287 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3269  putative signal transduction protein  28.12 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  25.69 
 
 
286 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  28.02 
 
 
280 aa  64.3  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.37 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  23.59 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  24.55 
 
 
455 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  26.07 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  27.4 
 
 
358 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  22.54 
 
 
407 aa  63.2  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  27.14 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  21.49 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  22.71 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
427 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  21.49 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  21.49 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  21.49 
 
 
274 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
409 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  24.23 
 
 
425 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4398  putative signal transduction protein  29.23 
 
 
468 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  28.32 
 
 
274 aa  62.4  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  28.32 
 
 
274 aa  62  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3720  putative signal transduction protein  25.27 
 
 
464 aa  62.4  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  27.02 
 
 
456 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  24.68 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  20.66 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  27.19 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  24.48 
 
 
324 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  23.26 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.12 
 
 
544 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  26.4 
 
 
287 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>