268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2713 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2713  putative signal transduction protein  100 
 
 		 278 aa  561  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  43.18 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0714  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.74 
 
 		 524 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0716  putative signal transduction protein  37.19 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.515332 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3073  putative signal transduction protein  38.92 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.605387  normal  0.0112451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.89 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.04 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  29.91 
 
 		 275 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  22.43 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.49 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  29.25 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  30.14 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3473  putative signal transduction protein  30.43 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 353 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.03 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  28.64 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.62 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.62 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  29.44 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  26.07 
 
 		 326 aa  79  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  29.68 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.4 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.51 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  22.22 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  27.6 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  25.26 
 
 		 292 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  27.54 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  24.79 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  25.21 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  24.38 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  24.79 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.44 
 
 		 716 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  24.79 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  24.79 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  21.49 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  25.97 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.61 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  30.09 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  30.09 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  25.84 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  28.51 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.8 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  23.86 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  25.62 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  29.1 
 
 		 634 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  26.85 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  23.67 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  23.67 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  21.08 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 299 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0344  putative signal transduction protein  27.09 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.961814  normal  0.37345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  26.42 
 
 		 718 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  29.49 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0432  putative signal transduction protein  30.8 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.299689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  23.66 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  26.87 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0557  Metal-dependent hydrolase HDOD  23.2 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.681688  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0319  two component diguanylate cyclase  28.71 
 
 		 661 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  23.88 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0544  putative signal transduction protein  24.55 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  24.4 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  22.37 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  23.72 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1669  putative signal transduction protein  23.23 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  28.7 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.61 
 
 		 696 aa  63.2  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  26.9 
 
 		 730 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  27.57 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1012  putative signal transduction protein  28.03 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  29.91 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  28.08 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0866  Metal-dependent hydrolase HDOD  23.21 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  23.61 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3873  Metal-dependent hydrolase HDOD  24.75 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.812708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.29 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  25.6 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  27.75 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  25.72 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.64 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  28.35 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  27.85 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  25.09 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.05 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.71 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3312  hypothetical protein  25.37 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.29 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  20.85 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.03 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  27.13 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  25.89 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>