161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1247 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1008    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  64.52 
 
 		 484 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  60.04 
 
 		 488 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  58.88 
 
 		 493 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  58.25 
 
 		 482 aa  594  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  58.69 
 
 		 488 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  58.25 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  58.49 
 
 		 488 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  58.25 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  58.25 
 
 		 491 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  58.08 
 
 		 488 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  59.58 
 
 		 494 aa  571  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  56.13 
 
 		 491 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  57.17 
 
 		 466 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  58.14 
 
 		 451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  32.98 
 
 		 486 aa  274  3e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  30.67 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  31.66 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  29.05 
 
 		 476 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  27.86 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  22.68 
 
 		 790 aa  103  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  25.11 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  23.66 
 
 		 790 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  31.49 
 
 		 546 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  22.7 
 
 		 824 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  22.97 
 
 		 791 aa  97.8  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  25.4 
 
 		 582 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  25.74 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.54 
 
 		 290 aa  72  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  25.35 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  25.35 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 274 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  25.12 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  21.69 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  23.96 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 		 292 aa  67  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  28.07 
 
 		 287 aa  66.6  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  24.17 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  23.5 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  23.5 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  24.17 
 
 		 484 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  24.17 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  24.17 
 
 		 502 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  25.59 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  24.64 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  24.17 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  24.06 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  23.72 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  23.5 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  23.11 
 
 		 285 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  26.97 
 
 		 293 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  23.56 
 
 		 507 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  23.56 
 
 		 507 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  24.41 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  24.34 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  27.63 
 
 		 280 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  21.54 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  22.71 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  21.18 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  21.67 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4242  metal-dependent hydrolase HDOD  23.95 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  22.07 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  22.45 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  21 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  24.68 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  24 
 
 		 485 aa  57  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.48 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  21.88 
 
 		 275 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  22.99 
 
 		 517 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  25 
 
 		 276 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.46 
 
 		 293 aa  56.6  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  21.78 
 
 		 282 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 		 280 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  27.95 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  30.2 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.97 
 
 		 634 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 284 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  20.78 
 
 		 480 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  22.08 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  25.18 
 
 		 730 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  25.48 
 
 		 289 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  28.99 
 
 		 275 aa  54.3  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 291 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  24.05 
 
 		 280 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 287 aa  53.9  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 427 aa  53.5  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  19.54 
 
 		 305 aa  53.5  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  24.3 
 
 		 284 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 282 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  23.68 
 
 		 274 aa  52.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.59 
 
 		 703 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  24.56 
 
 		 272 aa  53.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 280 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  21.86 
 
 		 277 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 		 350 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>