177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3025 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  76.97 
 
 		 466 aa  752    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  81.26 
 
 		 488 aa  836    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  81.26 
 
 		 488 aa  833    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  80.86 
 
 		 488 aa  830    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  99.59 
 
 		 491 aa  1009    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  98.98 
 
 		 491 aa  1006    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  99.53 
 
 		 451 aa  860    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  100 
 
 		 491 aa  1014    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  61.71 
 
 		 488 aa  623  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  58.25 
 
 		 489 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  57.73 
 
 		 482 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  59.34 
 
 		 484 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  58.2 
 
 		 493 aa  579  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  58.47 
 
 		 494 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  54 
 
 		 491 aa  531  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  31.67 
 
 		 486 aa  266  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  31.07 
 
 		 480 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  32.37 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  28.19 
 
 		 476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  28.78 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  25.99 
 
 		 790 aa  134  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  25.96 
 
 		 546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  23.35 
 
 		 824 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  23.78 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  23.06 
 
 		 790 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 791 aa  91.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  26.11 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  25.7 
 
 		 582 aa  78.2  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  22.4 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  22.73 
 
 		 488 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  22.37 
 
 		 484 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  22.75 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  27.52 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  27.72 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  27.72 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  27.72 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  26.57 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  26.07 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  24.46 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  24.46 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  24.46 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  24.46 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.64 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  21.22 
 
 		 507 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 502 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  21.11 
 
 		 507 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 507 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 507 aa  67  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26.44 
 
 		 517 aa  67  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.54 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 499 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  22.01 
 
 		 274 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  22.01 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  22.01 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  29.37 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  25.27 
 
 		 716 aa  64.7  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  21.53 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  23.12 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  25 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 		 703 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.5 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  28.3 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  22.33 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  25.47 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  22.47 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  26.43 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  22.77 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  21.54 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  24.45 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25.4 
 
 		 284 aa  56.6  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 292 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  20.79 
 
 		 285 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.02 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 		 297 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23 
 
 		 282 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  22.01 
 
 		 274 aa  55.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2695  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.01 
 
 		 284 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 283 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1128  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 270 aa  54.7  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.28 
 
 		 281 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  22.9 
 
 		 305 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  23.38 
 
 		 285 aa  53.9  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  21.99 
 
 		 297 aa  53.9  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.02 
 
 		 655 aa  53.9  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.01 
 
 		 275 aa  53.9  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  23.56 
 
 		 280 aa  53.5  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25 
 
 		 293 aa  53.5  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  22.49 
 
 		 287 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  24.62 
 
 		 286 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0622  putative signal transduction protein  30.14 
 
 		 279 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.21 
 
 		 297 aa  52.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  24.42 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.91 
 
 		 284 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>