157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1291 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  63.34 
 
 		 494 aa  638    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  66.12 
 
 		 493 aa  686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  100 
 
 		 491 aa  1016    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  62.63 
 
 		 482 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  58.96 
 
 		 488 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  56.13 
 
 		 489 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  55.97 
 
 		 488 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  56.17 
 
 		 488 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  55.97 
 
 		 488 aa  547  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  56.31 
 
 		 484 aa  542  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  54 
 
 		 491 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  54 
 
 		 491 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  54 
 
 		 491 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  52.89 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  55.58 
 
 		 451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  34.8 
 
 		 486 aa  288  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  28.28 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  30.27 
 
 		 477 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  28.93 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  28.49 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  24.8 
 
 		 546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  22.31 
 
 		 790 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  22.91 
 
 		 824 aa  106  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  22.93 
 
 		 488 aa  96.7  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  24.15 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  20.93 
 
 		 790 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  20.89 
 
 		 791 aa  90.5  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  27.1 
 
 		 582 aa  77  0.0000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  21.2 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  21.77 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  21.77 
 
 		 484 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  21.27 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  21.34 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  21.55 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  20.7 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  22.37 
 
 		 274 aa  67  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25.29 
 
 		 293 aa  67  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  22.37 
 
 		 274 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  22.37 
 
 		 274 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  22.37 
 
 		 274 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  21.69 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  21.32 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  23.83 
 
 		 274 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  27.72 
 
 		 284 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  26.73 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  26.54 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  24.49 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  20.32 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  23.37 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  24 
 
 		 507 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  20.78 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  24.73 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  19.96 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  23.96 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  20.61 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 284 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  20.61 
 
 		 274 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  20.61 
 
 		 274 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  22.47 
 
 		 499 aa  57  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  25 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  23.56 
 
 		 280 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  25.25 
 
 		 275 aa  55.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  31.03 
 
 		 280 aa  54.7  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  26.42 
 
 		 298 aa  54.3  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  22.07 
 
 		 502 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  22.84 
 
 		 284 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  39.36 
 
 		 272 aa  54.3  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  25.24 
 
 		 297 aa  54.3  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  23.89 
 
 		 283 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  25.9 
 
 		 274 aa  53.9  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  23.41 
 
 		 507 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  23.41 
 
 		 507 aa  53.9  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  22.92 
 
 		 351 aa  53.9  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2458  putative signal transduction protein  24.62 
 
 		 282 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  25.49 
 
 		 280 aa  53.5  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2001  HDOD domain-contain protein  28.21 
 
 		 272 aa  53.5  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 703 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  24.26 
 
 		 285 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  19.82 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  21.43 
 
 		 289 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  22.5 
 
 		 274 aa  52.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  24.37 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1569  putative signal transduction protein  32 
 
 		 283 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  23.91 
 
 		 282 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  22.71 
 
 		 297 aa  52  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  23.91 
 
 		 284 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.39 
 
 		 287 aa  50.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  25.43 
 
 		 275 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0348  putative signal transduction protein  30.3 
 
 		 285 aa  50.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0367  putative signal transduction protein  30.3 
 
 		 285 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  31.76 
 
 		 280 aa  50.1  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  21.23 
 
 		 282 aa  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 		 282 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  22.22 
 
 		 275 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  21.36 
 
 		 279 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>