162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1103 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  64.52 
 
 		 489 aa  664    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  100 
 
 		 484 aa  999    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  60.29 
 
 		 493 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  60.08 
 
 		 488 aa  596  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  59.34 
 
 		 491 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  59.67 
 
 		 488 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  59.75 
 
 		 491 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  59.88 
 
 		 488 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  59.46 
 
 		 488 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  57.62 
 
 		 482 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  59.34 
 
 		 491 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  57.59 
 
 		 494 aa  553  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  56.31 
 
 		 491 aa  542  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  58.46 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  60.96 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  33.89 
 
 		 486 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  29.98 
 
 		 480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  32.35 
 
 		 477 aa  229  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  28.84 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  27.6 
 
 		 470 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  23.41 
 
 		 790 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  32.89 
 
 		 546 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  23.41 
 
 		 790 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  22.29 
 
 		 824 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  23.77 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  23.96 
 
 		 791 aa  87.8  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  21.69 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.78 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  23.76 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  23.76 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  23.76 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  25.65 
 
 		 582 aa  66.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  21.71 
 
 		 480 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  23.27 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25.32 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  25.1 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.8 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  22.43 
 
 		 274 aa  63.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  21.96 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  22.6 
 
 		 274 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  22.07 
 
 		 292 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  21.46 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.83 
 
 		 287 aa  63.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 703 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  26.05 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 		 287 aa  62  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  22.6 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  22.6 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  26.05 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  24.53 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  25.58 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  23.58 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  23.88 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.27 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  20.87 
 
 		 485 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  23.55 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  24.06 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  24.06 
 
 		 484 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  25.47 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  25.47 
 
 		 507 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  24.06 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  24.41 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  21.89 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  22.13 
 
 		 730 aa  59.7  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  31.47 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  24.62 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  22.94 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.18 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  22.56 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  21.72 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  20.42 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  25.67 
 
 		 716 aa  58.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.27 
 
 		 634 aa  58.2  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  24.39 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  25.33 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  24.17 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  25.26 
 
 		 369 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  25.6 
 
 		 517 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  27.74 
 
 		 280 aa  56.6  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  22.73 
 
 		 274 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 353 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  25.25 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  25.5 
 
 		 304 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  24.03 
 
 		 544 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  21.21 
 
 		 282 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  24.71 
 
 		 281 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.36 
 
 		 284 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 285 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  21.95 
 
 		 282 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  22.06 
 
 		 290 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4242  metal-dependent hydrolase HDOD  24.91 
 
 		 283 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.76 
 
 		 289 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.36 
 
 		 283 aa  53.5  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.77 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  29.11 
 
 		 272 aa  52.8  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 378 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>