146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1529 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  64.09 
 
 		 482 aa  644    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  78.5 
 
 		 493 aa  795    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  63.34 
 
 		 491 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  100 
 
 		 494 aa  1016    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  61.12 
 
 		 488 aa  608  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  59.27 
 
 		 488 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  59.48 
 
 		 488 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  60.08 
 
 		 488 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  59.08 
 
 		 489 aa  587  1e-166  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  58.47 
 
 		 491 aa  578  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  58.47 
 
 		 491 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  58.87 
 
 		 491 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  57.59 
 
 		 484 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  56.93 
 
 		 466 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  60.56 
 
 		 451 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  32.24 
 
 		 486 aa  264  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  31.75 
 
 		 480 aa  249  9e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  30.82 
 
 		 477 aa  212  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  27.42 
 
 		 476 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  26.76 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  22.54 
 
 		 790 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  23.49 
 
 		 791 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  23.77 
 
 		 824 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  22.13 
 
 		 790 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  30.41 
 
 		 546 aa  98.2  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  24.14 
 
 		 476 aa  89.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  29.3 
 
 		 582 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  23.4 
 
 		 488 aa  86.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  21.95 
 
 		 480 aa  76.6  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  21.84 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  21.84 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  21.84 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  21.06 
 
 		 484 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  24.89 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  24.89 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  20.32 
 
 		 499 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  25.64 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  21.07 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  21.07 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  24.67 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  29.45 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.17 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  22.34 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  22.34 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  22.34 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  25.11 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  20.4 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  21.68 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  20.75 
 
 		 485 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  21.81 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  26.06 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  25.62 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  23.55 
 
 		 485 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  21.76 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  21.76 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  25.19 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  21.24 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  27.74 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  23.04 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.09 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2515  putative signal transduction protein  26.83 
 
 		 293 aa  57  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  21.14 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 703 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 		 284 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  21.89 
 
 		 297 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  41.49 
 
 		 272 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 283 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 285 aa  54.7  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  24.07 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  20.21 
 
 		 274 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.56 
 
 		 281 aa  54.7  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 		 280 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 283 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  22.87 
 
 		 274 aa  54.7  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 299 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1611  putative signal transduction protein  28.38 
 
 		 287 aa  53.9  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000391272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  30.67 
 
 		 280 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.9 
 
 		 284 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 427 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  22.77 
 
 		 284 aa  53.5  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 297 aa  53.5  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 285 aa  53.5  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  22.27 
 
 		 287 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  24.04 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 280 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  23.88 
 
 		 281 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25.55 
 
 		 284 aa  52.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  22.22 
 
 		 274 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 		 284 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  21.11 
 
 		 275 aa  52  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  25.47 
 
 		 352 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  22.84 
 
 		 397 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  23.14 
 
 		 497 aa  52  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  23.02 
 
 		 300 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25 
 
 		 303 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  26.22 
 
 		 280 aa  51.2  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>