178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0250 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  100 
 
 
470 aa  964    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  33.4 
 
 
476 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  32.85 
 
 
480 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  31.51 
 
 
477 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  30.66 
 
 
488 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  29.02 
 
 
488 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  28.39 
 
 
488 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  28.39 
 
 
488 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  27.6 
 
 
484 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  28.48 
 
 
489 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  28.98 
 
 
491 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  29.18 
 
 
491 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  28.29 
 
 
491 aa  179  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  28.78 
 
 
491 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  26.73 
 
 
482 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  26.96 
 
 
466 aa  170  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  26.76 
 
 
494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  25.56 
 
 
493 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  30.1 
 
 
451 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  24.17 
 
 
486 aa  105  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  34.74 
 
 
546 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  22.41 
 
 
790 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 
824 aa  96.3  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  22.42 
 
 
790 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  24.43 
 
 
481 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
284 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  28.74 
 
 
582 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  24.56 
 
 
791 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  23.09 
 
 
476 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  29.57 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  25.87 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  26.26 
 
 
287 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  23.88 
 
 
480 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  25.91 
 
 
281 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  28.38 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  26.04 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  26.42 
 
 
484 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
286 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  25.19 
 
 
284 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.94 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  25.74 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  26.83 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  27.59 
 
 
485 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  28.36 
 
 
485 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  25.94 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.18 
 
 
280 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  25.94 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  25.94 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  21.66 
 
 
300 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  24.79 
 
 
279 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  28.28 
 
 
477 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  27.69 
 
 
912 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  26.34 
 
 
283 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30.07 
 
 
352 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  25 
 
 
281 aa  63.9  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  21.77 
 
 
283 aa  63.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  25.26 
 
 
283 aa  63.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  26.15 
 
 
502 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  26.07 
 
 
499 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  26.45 
 
 
455 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  25.59 
 
 
507 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  28.67 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  25.59 
 
 
507 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  28.57 
 
 
272 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  25.76 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
282 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 
291 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  26.57 
 
 
507 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  26.57 
 
 
507 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  22.73 
 
 
291 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 
292 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  24.19 
 
 
284 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  27.18 
 
 
279 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.32 
 
 
293 aa  61.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.17 
 
 
303 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  28.17 
 
 
285 aa  60.8  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1203  response regulator  27.8 
 
 
634 aa  60.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  27.97 
 
 
499 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2242  putative signal transduction protein  26.32 
 
 
358 aa  60.8  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.667665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  23.83 
 
 
274 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  27.21 
 
 
282 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  26.42 
 
 
287 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  22.94 
 
 
289 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
284 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  23.23 
 
 
369 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  24.12 
 
 
275 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  21.52 
 
 
297 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  25.25 
 
 
280 aa  58.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2001  HDOD domain-contain protein  25.79 
 
 
272 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1929  hypothetical protein  24.8 
 
 
273 aa  58.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  24.53 
 
 
299 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  23.56 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  23.08 
 
 
274 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  23.08 
 
 
274 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  23.08 
 
 
274 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  23.35 
 
 
351 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  21.19 
 
 
512 aa  56.6  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.417106 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>