219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2025 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  100 
 
 		 476 aa  984    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  34.66 
 
 		 480 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  32.98 
 
 		 470 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 477 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  28.84 
 
 		 484 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  29.05 
 
 		 489 aa  216  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  30.06 
 
 		 488 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  28.93 
 
 		 491 aa  209  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  28.04 
 
 		 488 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 488 aa  206  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  28.25 
 
 		 488 aa  206  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  27.42 
 
 		 494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  28.19 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  27.35 
 
 		 493 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  28.34 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  26.54 
 
 		 482 aa  193  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  28.19 
 
 		 491 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  26.81 
 
 		 466 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  29.06 
 
 		 451 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  25.35 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  23.51 
 
 		 546 aa  115  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  23.71 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  23.06 
 
 		 824 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  24.31 
 
 		 481 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  23.24 
 
 		 791 aa  96.3  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  23.18 
 
 		 790 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 790 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.41 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  21.77 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  25 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  24.87 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  26.82 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  23.68 
 
 		 284 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  27.12 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  27.72 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  26.69 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  28.28 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  26.09 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  24.72 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  29.02 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  26.54 
 
 		 280 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  25.12 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  28.04 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  26.63 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  25.54 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  25.13 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  25.58 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  23.32 
 
 		 303 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.87 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.65 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  23.94 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  22.37 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  21.82 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  24.56 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  28.78 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  27.04 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  25 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  27.04 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  25.26 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  25.65 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  23.35 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  27.04 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  23.18 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.8 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  24.4 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.38 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  26.42 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  24.11 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  25 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25.89 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  23.05 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.53 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.17 
 
 		 305 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  29.25 
 
 		 716 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  21.76 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  24.65 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  24.37 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  24.37 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  26.82 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.26 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  23.67 
 
 		 507 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  23.67 
 
 		 507 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  23.55 
 
 		 502 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  24.37 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  19.79 
 
 		 730 aa  56.6  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  26.34 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.64 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  21.92 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  24.32 
 
 		 280 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>