33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0228 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  100 
 
 		 497 aa  998    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  33.33 
 
 		 481 aa  193  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  31.83 
 
 		 476 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  27.41 
 
 		 477 aa  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  24.65 
 
 		 480 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0579  putative signal transduction protein  26.56 
 
 		 457 aa  86.7  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0391082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1929  hypothetical protein  30.26 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  22.18 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  26.1 
 
 		 285 aa  72.4  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1611  putative signal transduction protein  31.3 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000391272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  21.64 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  21.89 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  21.89 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1031  Metal-dependent hydrolase HDOD  28.29 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0817905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  22.47 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  26.51 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  20.62 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  22.27 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  22.27 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4086  putative signal transduction protein  26.85 
 
 		 281 aa  54.3  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0216096  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  22.44 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  21.4 
 
 		 546 aa  50.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  30.06 
 
 		 586 aa  50.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  21.77 
 
 		 488 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4242  metal-dependent hydrolase HDOD  32.52 
 
 		 283 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  19.24 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3409  hypothetical protein  27.09 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  27.27 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  23.13 
 
 		 824 aa  48.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  21.44 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  22.07 
 
 		 451 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  31.62 
 
 		 280 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  21.04 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>