24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3409 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3409  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4242  metal-dependent hydrolase HDOD  58.6 
 
 		 283 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4086  putative signal transduction protein  55.16 
 
 		 281 aa  254  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  42.8 
 
 		 285 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1611  putative signal transduction protein  36.05 
 
 		 287 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000391272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1929  hypothetical protein  36.4 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  25.95 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  29.02 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1031  Metal-dependent hydrolase HDOD  26.79 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0817905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  25.53 
 
 		 494 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  25.09 
 
 		 476 aa  48.9  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  22.59 
 
 		 491 aa  46.6  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  24.69 
 
 		 451 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  24.69 
 
 		 491 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  24.69 
 
 		 491 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  24.69 
 
 		 491 aa  45.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  26.77 
 
 		 497 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  22.14 
 
 		 489 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  24.79 
 
 		 488 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  22.04 
 
 		 484 aa  43.1  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  21.9 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  27.12 
 
 		 481 aa  42.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  21.9 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  22.55 
 
 		 493 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>