36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1929 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1929  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  40.39 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4086  putative signal transduction protein  37.4 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0216096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4242  metal-dependent hydrolase HDOD  35.52 
 
 		 283 aa  132  6.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1611  putative signal transduction protein  34.54 
 
 		 287 aa  128  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000391272  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3409  hypothetical protein  36.6 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  30.65 
 
 		 476 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  30.65 
 
 		 497 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  28.75 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2971  hypothetical protein  30.8 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  31.55 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  24.8 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  25.38 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  22.66 
 
 		 476 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  25.11 
 
 		 491 aa  53.9  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  25.1 
 
 		 482 aa  52  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  24.58 
 
 		 493 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  25.96 
 
 		 480 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25.91 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  25.21 
 
 		 451 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  25.21 
 
 		 491 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  25.21 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  25.21 
 
 		 491 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.91 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.91 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  23.63 
 
 		 488 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  24.4 
 
 		 488 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  24.07 
 
 		 488 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  24.07 
 
 		 488 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  24.15 
 
 		 477 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  24.57 
 
 		 494 aa  43.9  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  24.86 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  24.86 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  24.86 
 
 		 274 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  24.86 
 
 		 274 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>