37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2971 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2971  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  33.72 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1929  hypothetical protein  29.2 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4086  putative signal transduction protein  28.05 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0216096  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2642  metal-dependent hydrolase HDOD  24.9 
 
 		 492 aa  68.9  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.994556  hitchhiker  0.000160222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  30.54 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1611  putative signal transduction protein  29.03 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000391272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4242  metal-dependent hydrolase HDOD  26.51 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  26.58 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  27.61 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  26.54 
 
 		 275 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3409  hypothetical protein  26.61 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  25.84 
 
 		 277 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  25.7 
 
 		 497 aa  50.1  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 274 aa  49.3  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  25.45 
 
 		 274 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  25.91 
 
 		 274 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  25.64 
 
 		 488 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  25.87 
 
 		 482 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  27.27 
 
 		 489 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  25.59 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  25.59 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  25.59 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.88 
 
 		 438 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  33.66 
 
 		 481 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  26.79 
 
 		 488 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  24.09 
 
 		 488 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  25.59 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  24.09 
 
 		 488 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  26.96 
 
 		 493 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  23.25 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  26.29 
 
 		 466 aa  43.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  23.04 
 
 		 485 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  26.15 
 
 		 480 aa  42.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  25.41 
 
 		 477 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  26.42 
 
 		 484 aa  42.4  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>