29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4242 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4242  metal-dependent hydrolase HDOD  100 
 
 		 283 aa  557  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3409  hypothetical protein  58.6 
 
 		 283 aa  288  6e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4086  putative signal transduction protein  49.28 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0216096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  40 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1611  putative signal transduction protein  38.28 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000391272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1929  hypothetical protein  35.52 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  26.28 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1031  Metal-dependent hydrolase HDOD  26.37 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0817905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  29.44 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  23.95 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  24.91 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  21.69 
 
 		 470 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  22.39 
 
 		 482 aa  50.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  25.55 
 
 		 491 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  25.55 
 
 		 451 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  21.79 
 
 		 493 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  25.55 
 
 		 491 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  24.6 
 
 		 486 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  23.95 
 
 		 491 aa  49.7  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  25.55 
 
 		 491 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  25.48 
 
 		 494 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  32.52 
 
 		 497 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  23.63 
 
 		 488 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  24.47 
 
 		 488 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  22.91 
 
 		 476 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  24.05 
 
 		 488 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2971  hypothetical protein  26.51 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  26.69 
 
 		 476 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28.14 
 
 		 397 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>