57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0840 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  578  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4086  putative signal transduction protein  42.53 
 
 		 281 aa  200  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0216096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3409  hypothetical protein  42.44 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1611  putative signal transduction protein  41.02 
 
 		 287 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000391272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4242  metal-dependent hydrolase HDOD  40 
 
 		 283 aa  179  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1929  hypothetical protein  40.87 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  26.3 
 
 		 476 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2971  hypothetical protein  33.72 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  27.76 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  26.15 
 
 		 470 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  25.86 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  26.39 
 
 		 497 aa  72.4  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  22.71 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  25.11 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  23.97 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  23.86 
 
 		 482 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  31.72 
 
 		 481 aa  56.6  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1031  Metal-dependent hydrolase HDOD  28.66 
 
 		 463 aa  55.8  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0817905  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  23.38 
 
 		 451 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  23.38 
 
 		 491 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  23.38 
 
 		 491 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  24.11 
 
 		 476 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  23.38 
 
 		 491 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  24.26 
 
 		 491 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  25.29 
 
 		 291 aa  52.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  23.71 
 
 		 493 aa  52  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  26.36 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  23.12 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 438 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  23.73 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  23.14 
 
 		 484 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  24.3 
 
 		 276 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  24.51 
 
 		 292 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2642  metal-dependent hydrolase HDOD  24.54 
 
 		 492 aa  49.3  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.994556  hitchhiker  0.000160222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  24.06 
 
 		 302 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  22.59 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.29 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  24.14 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  24.17 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  25 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  25.37 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  23.67 
 
 		 480 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  25.94 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  28.99 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  23.22 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  27.69 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  21.58 
 
 		 486 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  22.35 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  24.66 
 
 		 485 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  25.31 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  23.63 
 
 		 284 aa  43.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  23.58 
 
 		 466 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  23.41 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  20.83 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  21.67 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  23.96 
 
 		 485 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>