34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4086 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4086  putative signal transduction protein  100 
 
 		 281 aa  558  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0216096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3409  hypothetical protein  54.8 
 
 		 283 aa  246  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4242  metal-dependent hydrolase HDOD  49.28 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  42.53 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1611  putative signal transduction protein  39.45 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000391272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1929  hypothetical protein  37.4 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  27.1 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  26.67 
 
 		 477 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  26.85 
 
 		 497 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1031  Metal-dependent hydrolase HDOD  22.79 
 
 		 463 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0817905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  24.11 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2971  hypothetical protein  28.05 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.815157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  21.55 
 
 		 488 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  23.36 
 
 		 470 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2642  metal-dependent hydrolase HDOD  23.4 
 
 		 492 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.994556  hitchhiker  0.000160222 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  21.98 
 
 		 488 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  21.98 
 
 		 488 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  28.72 
 
 		 481 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  20.75 
 
 		 476 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  22.69 
 
 		 491 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  22.53 
 
 		 476 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  21.79 
 
 		 451 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  21.79 
 
 		 491 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  21.79 
 
 		 491 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  21.79 
 
 		 491 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0162  putative signal transduction protein  24.21 
 
 		 467 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.229614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0064  hypothetical protein  24.03 
 
 		 465 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5311  putative signal transduction protein  24.23 
 
 		 467 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0528676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5560  signal transduction protein  23.29 
 
 		 466 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0200  hypothetical protein  24.49 
 
 		 465 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5359  putative signal transduction protein  23.85 
 
 		 467 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  26.37 
 
 		 790 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  21.72 
 
 		 466 aa  42.7  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5220  putative signal transduction protein  23.85 
 
 		 467 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  0.743433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>