28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1506 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1506  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  947    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.107758  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0228  putative signal transduction protein  33.13 
 
 		 497 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.671698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  32.25 
 
 		 476 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  24.31 
 
 		 476 aa  94.4  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  24.43 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  26.48 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  22.31 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  21.24 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0579  putative signal transduction protein  25.86 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0391082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1031  Metal-dependent hydrolase HDOD  26.72 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0817905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  20.4 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  21.72 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  22.29 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  22.56 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  20.78 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  22.09 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  21.54 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1929  hypothetical protein  31.55 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.479061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  21.93 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  21.47 
 
 		 491 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0840  hypothetical protein  31.72 
 
 		 285 aa  56.6  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  23.31 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  21.07 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1611  putative signal transduction protein  32.24 
 
 		 287 aa  53.9  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000391272  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4086  putative signal transduction protein  28.72 
 
 		 281 aa  47.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0216096  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 		 279 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  23.77 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  19.14 
 
 		 489 aa  43.9  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>