168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1164 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  100 
 
 		 502 aa  1007    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  86.81 
 
 		 507 aa  856    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  76.29 
 
 		 484 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  93.19 
 
 		 499 aa  929    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  84.15 
 
 		 499 aa  841    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  76.69 
 
 		 484 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  98.03 
 
 		 507 aa  935    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  87.4 
 
 		 507 aa  854    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  98.03 
 
 		 507 aa  935    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  76.29 
 
 		 484 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  76.1 
 
 		 484 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  64.11 
 
 		 485 aa  617  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  65.85 
 
 		 485 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  64.84 
 
 		 485 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  58.57 
 
 		 488 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  35.84 
 
 		 480 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  34.82 
 
 		 477 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  28.63 
 
 		 790 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  31.76 
 
 		 791 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  26.44 
 
 		 546 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 824 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  26.84 
 
 		 790 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  27.97 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  26.32 
 
 		 477 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  25.91 
 
 		 493 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.37 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  22.93 
 
 		 298 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  20.61 
 
 		 482 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  26.17 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 491 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 491 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.07 
 
 		 634 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  26.21 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 451 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  26.79 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  26.21 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.15 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  24.17 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  24.76 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  22.03 
 
 		 494 aa  63.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  20 
 
 		 491 aa  63.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  25.65 
 
 		 632 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  27.52 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.02 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  26.19 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  26.89 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  28.74 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  30.51 
 
 		 286 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  25.58 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  26.16 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  24.35 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.09 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  22.61 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  23.7 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  21.43 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  23.3 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  26.77 
 
 		 466 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  25.38 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  20.77 
 
 		 283 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.29 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  21.78 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  25.24 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  20.29 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  23.98 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  19.87 
 
 		 486 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  26.47 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.09 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 703 aa  57  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  24.39 
 
 		 275 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  26.76 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  25.96 
 
 		 292 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.15 
 
 		 279 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 397 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.24 
 
 		 280 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.63 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  22.11 
 
 		 297 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.36 
 
 		 284 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  27.86 
 
 		 275 aa  54.3  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  23.86 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  28.73 
 
 		 283 aa  53.9  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 292 aa  53.9  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  20.29 
 
 		 299 aa  53.9  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  28.78 
 
 		 302 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  24.26 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  24.32 
 
 		 287 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  25.74 
 
 		 292 aa  52.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  24.46 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.03 
 
 		 716 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  25.12 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  23.56 
 
 		 912 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1361  putative signal transduction protein  33.14 
 
 		 282 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.758377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  19.81 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  27.83 
 
 		 373 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  33.33 
 
 		 349 aa  51.2  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.74 
 
 		 297 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>