174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1362 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  66.74 
 
 
485 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  75.49 
 
 
507 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  99.79 
 
 
484 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  77.06 
 
 
499 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  95.87 
 
 
484 aa  932    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  76.26 
 
 
499 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  74.95 
 
 
507 aa  722    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  75.64 
 
 
507 aa  731    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  74.95 
 
 
507 aa  722    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  99.79 
 
 
484 aa  974    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  976    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  76.1 
 
 
502 aa  727    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  67.65 
 
 
485 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  67.5 
 
 
485 aa  611  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  59.96 
 
 
488 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  36.29 
 
 
480 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  33.95 
 
 
477 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  29.55 
 
 
790 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  31.29 
 
 
791 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  27.97 
 
 
546 aa  163  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 
790 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 
824 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  29.11 
 
 
582 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  21.86 
 
 
482 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  26.53 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  27.93 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  21.78 
 
 
491 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  21.24 
 
 
491 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.09 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  25.98 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  27.72 
 
 
491 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  27.72 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  22.04 
 
 
494 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  26.42 
 
 
480 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  21.55 
 
 
491 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  26.59 
 
 
488 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  26.22 
 
 
488 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  24.9 
 
 
505 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  23.94 
 
 
517 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  26.7 
 
 
488 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.77 
 
 
283 aa  67  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  24.08 
 
 
407 aa  66.6  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  24.2 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.08 
 
 
634 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  26.24 
 
 
282 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  29.15 
 
 
286 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.5 
 
 
632 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  24.17 
 
 
489 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  28.04 
 
 
299 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  25 
 
 
280 aa  64.3  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 
279 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  29 
 
 
275 aa  63.9  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  30.9 
 
 
280 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  27.04 
 
 
466 aa  63.5  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  24.11 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  26 
 
 
397 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
703 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1264  diguanylate cyclase  26.51 
 
 
512 aa  62.4  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.417106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  25.46 
 
 
289 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  26.05 
 
 
470 aa  60.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  24.22 
 
 
275 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  24.06 
 
 
484 aa  60.1  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  25.49 
 
 
427 aa  60.1  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 
340 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  27.75 
 
 
287 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
284 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  26.07 
 
 
488 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  23.83 
 
 
274 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  25.12 
 
 
281 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.7 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  25.11 
 
 
292 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  25.3 
 
 
291 aa  57.8  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  21.24 
 
 
283 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  25.53 
 
 
284 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  20.49 
 
 
284 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.66 
 
 
303 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  26.98 
 
 
279 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  25.93 
 
 
276 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  20.73 
 
 
283 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  26.92 
 
 
586 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  25 
 
 
283 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  23.83 
 
 
378 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  24.07 
 
 
287 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  20.29 
 
 
486 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  26.34 
 
 
292 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  23.31 
 
 
280 aa  54.7  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1873  diguanylate cyclase  29.38 
 
 
509 aa  53.9  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2804  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 
598 aa  53.5  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  26.67 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  25 
 
 
297 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  24.49 
 
 
427 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  25.85 
 
 
305 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3230  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.37 
 
 
642 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.7142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  27.89 
 
 
716 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2025  putative signal transduction protein  25 
 
 
476 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0465595  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  22.53 
 
 
292 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  30.1 
 
 
276 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
297 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  22.53 
 
 
285 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>