176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2914 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1778  putative signal transduction protein  76.91 
 
 		 485 aa  760    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.8908 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1495  hypothetical protein  67.65 
 
 		 484 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2872  hypothetical protein  68.28 
 
 		 484 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2914  signal transduction protein-like  100 
 
 		 485 aa  983    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.87511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1569  putative signal transduction protein  96.29 
 
 		 485 aa  919    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1356  hypothetical protein  67.65 
 
 		 484 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1362  hypothetical protein  67.65 
 
 		 484 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4298  putative signal transduction protein  65.85 
 
 		 499 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.184086 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2117  putative signal transduction protein  64.57 
 
 		 499 aa  610  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1164  putative signal transduction protein  65.65 
 
 		 502 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115265 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0709  putative signal transduction protein  64.99 
 
 		 507 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1188  putative signal transduction protein  64.99 
 
 		 507 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1068  putative signal transduction protein  63.8 
 
 		 507 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1068  putative signal transduction protein  63.4 
 
 		 507 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5787  putative signal transduction protein  59.75 
 
 		 488 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.490103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5604  hypothetical protein  34.66 
 
 		 480 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1735  hypothetical protein  33.89 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00484301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1602  protein kinase:GAF  29.33 
 
 		 790 aa  194  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.711215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1797  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 791 aa  179  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0902277  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0100  signal transduction protein  26.2 
 
 		 546 aa  144  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.114046  normal  0.288231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2728  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 		 824 aa  128  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1364  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 790 aa  110  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.498929  normal  0.194256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1054  putative signal transduction protein  31.25 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  29.39 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1353  putative signal transduction protein  22.58 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000653082  unclonable  0.00000000000231151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3025  putative signal transduction protein  22.58 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00183954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3168  putative signal transduction protein  22.58 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  unclonable  0.00000465328 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0557  putative signal transduction protein  27.04 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3010  putative signal transduction protein  27.52 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0105038  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1209  putative signal transduction protein  26.62 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  23.98 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1291  putative signal transduction protein  20.7 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1208  putative signal transduction protein  26.25 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00549389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1279  putative signal transduction protein  22.48 
 
 		 488 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.013927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1277  putative signal transduction protein  21.49 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4407  hypothetical protein  27.57 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2062  putative signal transduction protein  25 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.100878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2379  putative signal transduction protein  24.41 
 
 		 488 aa  66.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  23.88 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  23.27 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1247  hypothetical protein  21.54 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.349611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  25 
 
 		 280 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  24.64 
 
 		 280 aa  63.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1977  putative signal transduction protein  25.11 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  22.77 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  26.09 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  28.12 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0250  putative signal transduction protein  26.53 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.889459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3068  metal dependent phosphohydrolase  26.47 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.896972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1416  putative signal transduction protein  23.28 
 
 		 493 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1103  putative signal transduction protein  20.87 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4398  hypothetical protein  26.89 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  22.17 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2971  serine/threonine protein kinase-like protein  26.47 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.164184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2023  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  28.46 
 
 		 632 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  24.49 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.49 
 
 		 634 aa  60.1  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  23.66 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  26 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  24.02 
 
 		 297 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  23.68 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  29.85 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1529  putative signal transduction protein  20.88 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.977426  normal  0.03285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3337  hypothetical protein  26.79 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  27.49 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  27.98 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  31.95 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  24.85 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  26.74 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.09 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  23.76 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  25.11 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1582  thiamine-phosphate kinase  25.11 
 
 		 272 aa  57  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  23.76 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 703 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  25.62 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  24.64 
 
 		 277 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 		 284 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.13 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  26.4 
 
 		 297 aa  55.1  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  24.12 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  21.8 
 
 		 297 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1323  putative signal transduction protein  26.74 
 
 		 476 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.282046  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.09 
 
 		 352 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3043  putative signal transduction protein  28.51 
 
 		 276 aa  54.3  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211419  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  21.43 
 
 		 285 aa  53.9  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  22.82 
 
 		 274 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  22.82 
 
 		 274 aa  53.9  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  22.82 
 
 		 274 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1009  hypothetical protein  21.53 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.26696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4164  hypothetical protein  28.07 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.511552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1986  metal dependent phosphohydrolase  23.5 
 
 		 280 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0536621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  22.94 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  22.86 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  23.44 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>