244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0005 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 350 aa  713    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  61.02 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  61.3 
 
 		 346 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  61.02 
 
 		 346 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  61.02 
 
 		 346 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  60.56 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  60.45 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  60.97 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  59 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  55.52 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  68.91 
 
 		 266 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0005  metal dependent phosphohydrolase  54.19 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  52.44 
 
 		 351 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0011  putative signal transduction protein  52.73 
 
 		 334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000072807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 		 384 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0287  hypothetical protein  31.07 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  29.13 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2952  putative signal transduction protein  26.91 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.281688  normal  0.0690285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 718 aa  75.9  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  27.37 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  29.7 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  27.91 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  23.05 
 
 		 730 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  29.38 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  27.41 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  27.81 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.46 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  27.62 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  22.61 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  27.19 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  31.29 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3052  putative signal transduction protein  25 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  26.6 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  22.22 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  28.18 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  26.13 
 
 		 397 aa  67  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.32 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  28.18 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  28.18 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  28.18 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1910  metal dependent phosphohydrolase  30.89 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  30.33 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  23.62 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  26.09 
 
 		 279 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  26.63 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  24.41 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  26.02 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  25.5 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0899  putative signal transduction protein  27.74 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2456  hypothetical protein  26.14 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3899  metal dependent phosphohydrolase  26.85 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  24.58 
 
 		 399 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0449  hypothetical protein  29.07 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  29.17 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0875  signal transduction protein  25.1 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  28.96 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0484  metal-dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1683  HDIG  28.99 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2585  putative signal transduction protein  25.69 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  22.92 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  21.63 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.42 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  28.47 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1771  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0336853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  24.88 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2694  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04660  hypothetical protein  28.49 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  21.62 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  24.73 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  32.85 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  28.26 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  22.06 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2909  metal-dependent phosphohydrolase  28.96 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600973  normal  0.363943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5352  signal transduction protein  26.37 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1061  putative signal transduction protein  24.28 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.580141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  26.14 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  27.91 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  27.66 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3984  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0460  putative signal transduction protein  23.12 
 
 		 280 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.798096  normal  0.334543 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  27.82 
 
 		 282 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  27.82 
 
 		 292 aa  57  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.99 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  28.36 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1050  putative signal transduction protein  25.53 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00648352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  28.33 
 
 		 256 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  27.22 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>