More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1039 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 567 aa  1159    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.45 
 
 		 575 aa  297  4e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  31.17 
 
 		 574 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  30.97 
 
 		 568 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  30.21 
 
 		 568 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  30.89 
 
 		 562 aa  280  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  31.12 
 
 		 563 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  30.59 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  30.12 
 
 		 564 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 563 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 563 aa  276  8e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  30.34 
 
 		 567 aa  273  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 572 aa  270  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  30.11 
 
 		 575 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  29.7 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  29.16 
 
 		 571 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  29.79 
 
 		 563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  28.08 
 
 		 548 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  29.51 
 
 		 568 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  27.07 
 
 		 568 aa  220  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  25.56 
 
 		 561 aa  189  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  28.5 
 
 		 365 aa  173  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  25.04 
 
 		 577 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  25.48 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  24.23 
 
 		 577 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  24.23 
 
 		 577 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  23.47 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  26.3 
 
 		 393 aa  157  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  28.14 
 
 		 383 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  23 
 
 		 565 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  22.66 
 
 		 567 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  22.66 
 
 		 567 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  28.65 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  31.2 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  29.02 
 
 		 378 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  24.32 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  24.21 
 
 		 369 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  26.44 
 
 		 373 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.98 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.43 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  32.66 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.42 
 
 		 371 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.29 
 
 		 378 aa  100  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.63 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  24.14 
 
 		 391 aa  93.6  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  24.72 
 
 		 434 aa  93.6  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  26.38 
 
 		 504 aa  90.9  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2841  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  30.52 
 
 		 308 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.98 
 
 		 423 aa  90.1  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.03 
 
 		 379 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3131  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 464 aa  89.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.41 
 
 		 400 aa  88.6  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 379 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.41 
 
 		 470 aa  88.6  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.03 
 
 		 379 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  22.67 
 
 		 415 aa  87.4  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  40.83 
 
 		 969 aa  87  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.62 
 
 		 460 aa  87  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  39.17 
 
 		 971 aa  87  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1475  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.21 
 
 		 311 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1502  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.21 
 
 		 311 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 1049 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0493  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.274957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.86 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.2 
 
 		 526 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.37 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  25.07 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  37.93 
 
 		 980 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3557  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.457648  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.34 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.37 
 
 		 869 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1055  two component signal transduction response regulator  30.77 
 
 		 734 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0148851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3625  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 322 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.65 
 
 		 869 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.4 
 
 		 392 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.44 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 234 aa  82.8  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  21.86 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 1907 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  21.5 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0702  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.66 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  23.51 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2820  response regulator  35.59 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.229785  normal  0.330149 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3473  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.54 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1038  sensory box histidine kinase/response regulator  29.31 
 
 		 513 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 374 aa  80.1  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2464  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.54 
 
 		 229 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 369 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2296  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  31.76 
 
 		 402 aa  80.1  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 120 aa  80.1  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 120 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.45 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  38.02 
 
 		 255 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1090 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 		 1090 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>