More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1558 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  100 
 
 		 566 aa  1154    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0208  response regulator receiver domain-containing protein  27.89 
 
 		 564 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  26.91 
 
 		 577 aa  134  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  25.14 
 
 		 564 aa  121  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  24.58 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  25.13 
 
 		 380 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 563 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  38.71 
 
 		 226 aa  106  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  24.39 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  25.31 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  25.13 
 
 		 562 aa  104  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  24.87 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  23.72 
 
 		 568 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  23.63 
 
 		 571 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  24.26 
 
 		 563 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  23.75 
 
 		 571 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  29.41 
 
 		 567 aa  100  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.32 
 
 		 566 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  23.06 
 
 		 568 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  23.99 
 
 		 380 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  23.53 
 
 		 380 aa  97.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  23.97 
 
 		 380 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  23.27 
 
 		 380 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  23.97 
 
 		 358 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  95.5  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  23.69 
 
 		 380 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  25.36 
 
 		 568 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  23.69 
 
 		 380 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  25.91 
 
 		 548 aa  95.9  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.85 
 
 		 425 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.79 
 
 		 380 aa  94.7  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 229 aa  94  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  23.04 
 
 		 575 aa  92.8  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.19 
 
 		 371 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0987  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 420 aa  91.3  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  29.06 
 
 		 394 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  29.06 
 
 		 394 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  26.8 
 
 		 367 aa  90.9  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 226 aa  90.9  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2098  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 547 aa  90.5  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000413163 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  35.09 
 
 		 226 aa  90.1  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0281  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 526 aa  90.1  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.630164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  23.66 
 
 		 574 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  24.64 
 
 		 567 aa  90.1  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  36.21 
 
 		 225 aa  89.7  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 547 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1041  response regulator receiver protein  30.56 
 
 		 365 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.44 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  29.59 
 
 		 226 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  28.51 
 
 		 394 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  33.97 
 
 		 228 aa  89.4  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.18 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  27.42 
 
 		 412 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.74 
 
 		 389 aa  87.8  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  29.59 
 
 		 226 aa  87.8  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  27.92 
 
 		 561 aa  87.4  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  22.16 
 
 		 577 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.7 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 393 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  38.52 
 
 		 225 aa  86.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  22.66 
 
 		 563 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  28.26 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 636 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.26 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0876  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.85 
 
 		 709 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0730078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  26.52 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  29 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  23.79 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  21.61 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.78 
 
 		 616 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  24.73 
 
 		 568 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  22.44 
 
 		 577 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 396 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  21.44 
 
 		 567 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  21.01 
 
 		 567 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  31.82 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  34.71 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.48 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.9 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2195  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 502 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.92 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0115  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.29 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.113218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.01 
 
 		 953 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.14 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  23.34 
 
 		 572 aa  80.9  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  22.01 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  24.25 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0280  Fis family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.928901  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0984  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  29.71 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  28.51 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.69 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2024  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 517 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0969  response regulator receiver domain-containing protein  27.86 
 
 		 328 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.749991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3851  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.39 
 
 		 634 aa  79.7  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0571122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 244 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 119 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.86 
 
 		 953 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>