More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1991 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  35.96 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  32.42 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  33.48 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  33.48 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  34.65 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  33.77 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  34.21 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  35.32 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  34.65 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  31.84 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.84 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  35.81 
 
 		 228 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  30.42 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  30.67 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  26.34 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23040  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  26.2 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.318653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  28.7 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  29.24 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  26.55 
 
 		 236 aa  94.7  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 566 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  26.43 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2724  response regulator receiver domain-containing protein  27.27 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.480114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  26.43 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  31.36 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.47 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  26.81 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  27.23 
 
 		 237 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2122  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.25 
 
 		 953 aa  92.8  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0111685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  28.12 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0968  two component transcriptional regulator  24.11 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000899876  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 242 aa  92  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3794  two component transcriptional regulator  29.49 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0280755  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 226 aa  91.7  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1399  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.94 
 
 		 476 aa  91.7  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.5 
 
 		 616 aa  91.7  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.99 
 
 		 243 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  29.49 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0432  putative two-component regulator  29.46 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0735185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  27.83 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  25 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  27.83 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  27.51 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2096  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.58 
 
 		 953 aa  90.5  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000903564 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  27.07 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5569  DNA-binding response regulator  28.45 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  26.87 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.99 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3118  DNA-binding response regulator  26.24 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.82 
 
 		 425 aa  89  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5385  DNA-binding response regulator  28.15 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  26.96 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  25.22 
 
 		 248 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  27.43 
 
 		 248 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2522  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.76 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  25.22 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0856  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.89 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  27.39 
 
 		 223 aa  88.2  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.99 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  25.22 
 
 		 248 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.99 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.09 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  27.39 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.56 
 
 		 244 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  27.39 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  25.88 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  25.22 
 
 		 248 aa  87.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.33 
 
 		 438 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  26.61 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  26.43 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  26.61 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.88 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  29.07 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  26.61 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  27.04 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  29.2 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  28.95 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  26.18 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  26.61 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  26.24 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5433  DNA-binding response regulator  26.96 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  27.83 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  27.56 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  24.78 
 
 		 229 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1378  response regulator receiver domain-containing protein  29.75 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321431  normal  0.0110306 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  26.96 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  24.12 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  24.34 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  26.87 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1219  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 396 aa  85.1  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  26.99 
 
 		 243 aa  85.1  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>