More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2139 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  34.07 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  34.88 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 229 aa  121  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  32.11 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  33.78 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  31.62 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  30.49 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  31.31 
 
 		 225 aa  115  7.999999999999999e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  32.89 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  29.49 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.56 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 		 228 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  31.31 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  28.11 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  33.18 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  30.09 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  31.02 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  30.7 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  29.03 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.88 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  32.58 
 
 		 228 aa  106  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  29.49 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  27.65 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  27.65 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  32.27 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.96 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  28.5 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.16 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02407  two-component system regulatory protein  29.03 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.5 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.65 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  28.04 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  30.54 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  27.19 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0203  response regulator receiver  33.92 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.359659 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.77 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2563  transcriptional regulatory protein ResD  28.64 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00803163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.63 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.04 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  28.04 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4970  two component transcriptional regulator  29.02 
 
 		 228 aa  100  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.04 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.19 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  28.64 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  29.3 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  27.4 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  29.15 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  29.17 
 
 		 221 aa  99.8  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  29.33 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  28.37 
 
 		 220 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  31.53 
 
 		 227 aa  99.8  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  24.89 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.98 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1041  response regulator receiver protein  39.84 
 
 		 365 aa  98.6  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  29.17 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  28.51 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1234  EAL domain protein  34.04 
 
 		 589 aa  96.7  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.89994  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  28.7 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0987  response regulator receiver domain-containing protein  34.27 
 
 		 420 aa  97.1  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2426  DNA-binding response regulator  28.12 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0189  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.46 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.364869 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  29.91 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  28.36 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.05 
 
 		 221 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  26.98 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.68 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  28.18 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.73 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  28.24 
 
 		 223 aa  95.1  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5352  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.68 
 
 		 224 aa  95.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  28.18 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.86 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.19 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.18 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.65 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  26.84 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  27.27 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1287  two component transcriptional regulator  26.39 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0339445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  27.52 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  27.15 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1759  two component transcriptional regulator  29.22 
 
 		 220 aa  93.6  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  37.9 
 
 		 566 aa  94.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.25 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  28.38 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>