More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1880 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  36.2 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  35.16 
 
 		 225 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  33.79 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  32.44 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  34.7 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  33.49 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  33.63 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  31.34 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  30 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  31.96 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  34.42 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  35.16 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  34.42 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  31.98 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0685  response regulator receiver  30.22 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  35.98 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  31.63 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  34.58 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  37.09 
 
 		 220 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  29.91 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.51 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  32.09 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0749  two component transcriptional regulator  29.63 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  30.18 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  28.5 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1516  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346089  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0892  response regulator receiver  29.02 
 
 		 233 aa  92  6e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  27.98 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0964  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 258 aa  91.7  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.412408  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1991  two component transcriptional regulator  27.93 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.656084  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  29.19 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  30.48 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2133  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.64 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.809783 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0432  putative two-component regulator  26.51 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0735185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0086  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.18 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000430601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3615  two component transcriptional regulator  27.12 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.78 
 
 		 224 aa  85.9  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  27.93 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.13 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  27.15 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  30.81 
 
 		 214 aa  84.7  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.58 
 
 		 1629 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.09 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  27.06 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  28.24 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.36 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  29.22 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  25 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  29.09 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03275  two-component system, transcriptional regulatory protein  30.49 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  26.85 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  30.46 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  30.46 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  26.4 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4110  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.42 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.73 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  27.06 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0587  two component transcriptional regulator  30.18 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  26.85 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  29.36 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  26.7 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  27.57 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  28.31 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  26.94 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  28.05 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.48 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  27.31 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  28.05 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  28.77 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  29.22 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0009  two component transcriptional regulator  27.96 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0898  DNA-binding response regulator  27.57 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  27.6 
 
 		 799 aa  82  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0837  two component transcriptional regulator  24.68 
 
 		 269 aa  82  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1171  transcriptional regulatory protein YedW  28.7 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  28.18 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  24.66 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4900  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.19 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.196174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  28.89 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  28.7 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1090  DNA-binding response regulator  28.95 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00019826  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.38 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7229  two-component response regulator  26.79 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.28 
 
 		 635 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1160  transcriptional regulatory protein YedW  28.7 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.728212 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  25.45 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1191  transcriptional regulatory protein YedW  28.7 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0102  two component heavy metal response transcriptional regulator  27.6 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.753235  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1055  transcriptional regulatory protein YedW  28.7 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>