More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7229 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7229  two-component response regulator  100 
 
 		 229 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2017  two component transcriptional regulator  82.06 
 
 		 223 aa  347  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.406269 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 224 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2516  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 224 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  38.91 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  39.91 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  38.07 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 224 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 220 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  34.09 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.32 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.82 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  41.29 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  41.29 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  39.55 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1280  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1501  DNA-binding response regulator TctD  38.39 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0114  DNA-binding response regulator TctD  38.39 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2277  DNA-binding response regulator TctD  38.39 
 
 		 287 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4343  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 222 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0952  DNA-binding response regulator TctD  38.39 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  37.67 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1037  transcriptional regulatory protein TctD  38.39 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4016  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.37 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727043  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  41.03 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1127  DNA-binding response regulator TctD  38.12 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1724  DNA-binding response regulator TctD  38.12 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0825207  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4764  two-component response regulator  38.12 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  38.74 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1376  DNA-binding response regulator IrlR  35.45 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.498923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.82 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.82 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  36.82 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  36.89 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1180  transcriptional activator IrlR  35.91 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0831411  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1524  transcriptional activator protein IrlR  35.91 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1028  DNA-binding response regulator IrlR  35.91 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0282692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0402  transcriptional activator IrlR  35.91 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0800763  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0030  DNA-binding response regulator IrlR  35.91 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122488  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0010  transcriptional activator IrlR  35.91 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.121051  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1439  transcriptional activator IrlR  35.91 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  36.89 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  38.01 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0310  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  40.27 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.45 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.12 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3842  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.45 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.45 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54510  two-component response regulator  37.67 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.377152 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  35.45 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>