More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3399 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  85.19 
 
 		 220 aa  349  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  78.08 
 
 		 223 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.34 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  71.3 
 
 		 219 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  66.37 
 
 		 225 aa  311  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  71.23 
 
 		 219 aa  306  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  64.09 
 
 		 221 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  64.84 
 
 		 219 aa  284  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  63.89 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  63.89 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  64.81 
 
 		 219 aa  277  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  64.35 
 
 		 219 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  65.74 
 
 		 232 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  66.2 
 
 		 219 aa  265  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  65.74 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  65.74 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  65.74 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  65.74 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  65.74 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  65.74 
 
 		 219 aa  265  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  63.89 
 
 		 219 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  62.5 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  56.02 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 		 222 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  51.39 
 
 		 221 aa  207  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 220 aa  207  9e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 220 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.53 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.21 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 235 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.75 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  51.39 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 242 aa  201  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 279 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.58 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  47.53 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 242 aa  198  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.85 
 
 		 224 aa  197  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 222 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.13 
 
 		 219 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.49 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.39 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  47.96 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  50.47 
 
 		 220 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.03 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.79 
 
 		 218 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  50.69 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  49.77 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  46.73 
 
 		 219 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 283 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  47 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  49.31 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 221 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  48.15 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0471  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 227 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  43.52 
 
 		 232 aa  188  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.93 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  48.85 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  47.2 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  43.52 
 
 		 223 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  49.31 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3148  two component response regulator  51.2 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.174373  hitchhiker  0.000575412 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>