More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3430 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  99.55 
 
 		 220 aa  421  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  82.65 
 
 		 220 aa  353  8.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  61.47 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0471  two component transcriptional regulator  61.82 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  57.87 
 
 		 220 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  63.43 
 
 		 220 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.26 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.41 
 
 		 220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  57.41 
 
 		 219 aa  221  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4906  two component transcriptional regulator  59.26 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4359  two component transcriptional regulator  59.26 
 
 		 219 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  47.95 
 
 		 225 aa  214  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  51.36 
 
 		 227 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 223 aa  207  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.04 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 227 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 222 aa  204  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  51.61 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  51.82 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  51.36 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  51.36 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  51.36 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  51.36 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  51.36 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 224 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  52.75 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  51.36 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 220 aa  198  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  50.93 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  46.58 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.39 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.07 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  50.93 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 220 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  50.93 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  50.93 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  50.93 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  50.93 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  50.93 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.54 
 
 		 223 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.17 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 220 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  41.74 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  47.66 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.71 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  49.09 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  50.94 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.49 
 
 		 219 aa  188  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 221 aa  187  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  42.6 
 
 		 232 aa  187  8e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  47.71 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.71 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  47.71 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.71 
 
 		 219 aa  187  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.71 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.81 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3935  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  50.47 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.78 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.78 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  42.34 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  48.18 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.78 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.78 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.78 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>