More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4177 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
223 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4240  two component transcriptional regulator, winged helix family  78.8 
 
 
220 aa  318  5e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.971314  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4530  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.42 
 
 
220 aa  314  8e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3990  two component transcriptional regulator  74.65 
 
 
220 aa  313  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.300119  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  67.58 
 
 
219 aa  306  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  68.2 
 
 
219 aa  304  6e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  68.2 
 
 
219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  68.2 
 
 
219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  68.2 
 
 
219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  68.2 
 
 
219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  68.2 
 
 
219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  68.2 
 
 
219 aa  303  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.74 
 
 
219 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  67.74 
 
 
219 aa  301  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  67.74 
 
 
219 aa  301  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  67.74 
 
 
219 aa  301  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  67.74 
 
 
219 aa  301  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  67.74 
 
 
219 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3490  DNA-binding transcriptional regulator QseB  65.9 
 
 
215 aa  288  6e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 
220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  56.07 
 
 
220 aa  237  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 
220 aa  234  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  52.75 
 
 
224 aa  232  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  53.02 
 
 
224 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 
222 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 
225 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 
224 aa  228  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2754  two-component system response regulator  52.7 
 
 
225 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.864218  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.46 
 
 
218 aa  226  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 
224 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 
220 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  54.67 
 
 
221 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 
220 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  54.21 
 
 
221 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 
220 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 
220 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 
220 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 
220 aa  224  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 
220 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
235 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 
227 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  53.27 
 
 
241 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 
224 aa  222  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  52.73 
 
 
249 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  50.68 
 
 
235 aa  220  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  48.44 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  52.34 
 
 
283 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  48.61 
 
 
219 aa  218  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2624  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 
239 aa  217  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 
279 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.9 
 
 
244 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 
219 aa  214  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  48.6 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 
221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  46.02 
 
 
246 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.69 
 
 
219 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 
221 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  50 
 
 
223 aa  209  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
220 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  50 
 
 
219 aa  209  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
233 aa  209  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 
220 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.6 
 
 
219 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  51.46 
 
 
210 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
220 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 
220 aa  207  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 
220 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
227 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 
221 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  46.08 
 
 
221 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  46.08 
 
 
221 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  50.7 
 
 
221 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 
220 aa  204  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.07 
 
 
219 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  46.19 
 
 
225 aa  204  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 
220 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  48.87 
 
 
227 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  45.37 
 
 
220 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 
221 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 
220 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  42.66 
 
 
232 aa  203  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  42.66 
 
 
223 aa  202  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 
220 aa  201  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 
227 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 
220 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.66 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.66 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  47 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.66 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  46.04 
 
 
225 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  46.04 
 
 
225 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 
227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.117296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>