More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1783 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  56.68 
 
 		 219 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 		 227 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.3 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  55 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  54.09 
 
 		 220 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  54.17 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  54.75 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.7 
 
 		 224 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.27 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  48.65 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  48.65 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  54.17 
 
 		 255 aa  221  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  54.55 
 
 		 221 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  52.75 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  53.46 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  53.46 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  53.46 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  53.46 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  53.46 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  53.46 
 
 		 220 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  50.46 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  49.07 
 
 		 218 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 222 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 220 aa  211  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 220 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  211  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  52.73 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  53.74 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  53.74 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 224 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 224 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  53.74 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  53.74 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  53.74 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.85 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.85 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  208  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  54.17 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 227 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.07 
 
 		 219 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  52.8 
 
 		 220 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 223 aa  207  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.39 
 
 		 219 aa  207  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 222 aa  207  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 220 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  53.77 
 
 		 241 aa  207  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 220 aa  207  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  51.39 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  46.54 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.39 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.39 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  51.39 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.39 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.39 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.39 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.39 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.39 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  51.39 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  53.3 
 
 		 283 aa  205  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  50 
 
 		 223 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 220 aa  204  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  52.34 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  47 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.47 
 
 		 219 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  204  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 219 aa  203  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.47 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4530  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.46 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698088  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  50 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1981  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  47.52 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  47.52 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2754  two-component system response regulator  49.09 
 
 		 225 aa  202  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.864218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.82 
 
 		 220 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>