More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1255 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  449  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  62.44 
 
 
232 aa  296  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  62.44 
 
 
223 aa  295  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  57.34 
 
 
218 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  57.87 
 
 
220 aa  259  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.34 
 
 
220 aa  257  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  58.41 
 
 
221 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  58.41 
 
 
221 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  52.97 
 
 
220 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  53.21 
 
 
219 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  54.84 
 
 
220 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  53.92 
 
 
220 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.49 
 
 
224 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  53.92 
 
 
220 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  52.05 
 
 
222 aa  246  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  53.46 
 
 
220 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.29 
 
 
219 aa  245  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 
220 aa  244  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  55.05 
 
 
227 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  52.75 
 
 
223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.75 
 
 
219 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  54.59 
 
 
220 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 
221 aa  241  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  53.02 
 
 
223 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  53.21 
 
 
220 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  53.02 
 
 
221 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
228 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  53.88 
 
 
225 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 
220 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  52.97 
 
 
224 aa  234  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 
224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 
219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  53.46 
 
 
241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 
219 aa  231  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  51.83 
 
 
218 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  50.47 
 
 
219 aa  230  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 
227 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  48.02 
 
 
246 aa  228  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 
279 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
219 aa  228  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  52.53 
 
 
283 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 
244 aa  228  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  51.33 
 
 
225 aa  228  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 
221 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  48.86 
 
 
220 aa  225  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.86 
 
 
220 aa  225  4e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 
221 aa  225  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  51.4 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
235 aa  224  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  49.55 
 
 
242 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  52.53 
 
 
220 aa  222  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 
220 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 
220 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  49.54 
 
 
218 aa  222  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 
220 aa  222  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.92 
 
 
220 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  52.15 
 
 
210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
220 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  52.8 
 
 
220 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  52.8 
 
 
220 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 
221 aa  217  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 
219 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 
219 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 
219 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 
219 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.13 
 
 
219 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.73 
 
 
219 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.73 
 
 
219 aa  216  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 
227 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 
220 aa  216  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.26 
 
 
219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  48.18 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  48.18 
 
 
221 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2624  two component transcriptional regulator  49.5 
 
 
239 aa  215  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.73 
 
 
223 aa  215  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.44 
 
 
219 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  49.07 
 
 
227 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 
227 aa  214  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  46.26 
 
 
219 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  46.26 
 
 
219 aa  214  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.26 
 
 
219 aa  214  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.26 
 
 
219 aa  214  8e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3293  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 
221 aa  214  9e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  46.58 
 
 
221 aa  213  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.93 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.93 
 
 
220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>