More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003617 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0139  DNA-binding response regulator  76.15 
 
 		 218 aa  321  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  66.51 
 
 		 218 aa  299  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  50.69 
 
 		 220 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 220 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  49.51 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  49.51 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  49.31 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  49.31 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  49.31 
 
 		 220 aa  209  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.87 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  47.27 
 
 		 232 aa  207  8e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  45.87 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  47.27 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  48.61 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  48.61 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  48.61 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  48.61 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  48.17 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  48.61 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 223 aa  204  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  47 
 
 		 220 aa  204  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 225 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 224 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 241 aa  201  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 283 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 228 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.87 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 244 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 279 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.87 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  45.87 
 
 		 232 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  45.87 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 221 aa  197  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 220 aa  197  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  44.49 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1128  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.3 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.40399  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2786  response regulator  44.12 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.12 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.25 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4016  DNA-binding transcriptional regulator BasR  47.71 
 
 		 222 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727043  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.3 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  45.16 
 
 		 220 aa  194  9e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  44.5 
 
 		 227 aa  194  9e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  46.54 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  45.83 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  45.83 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2104  DNA-binding response regulator YgiX, putative  43.98 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.37 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 		 219 aa  191  5e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  47.66 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  47.66 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.08 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  47.66 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 255 aa  191  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  47.66 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  47.66 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  47.66 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1885  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1827  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00738443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2150  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00200664  normal  0.32319 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  45.79 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>