More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2786 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2786  response regulator  100 
 
 		 243 aa  494  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  55.83 
 
 		 222 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  53.56 
 
 		 221 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  47.9 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.48 
 
 		 220 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 221 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  43.75 
 
 		 232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  43.33 
 
 		 223 aa  199  5e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  44.12 
 
 		 218 aa  196  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.12 
 
 		 218 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  43.51 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  42.26 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  42.68 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  47.48 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.93 
 
 		 225 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  47.06 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  44.12 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  44.77 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  44.77 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.12 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  44.77 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  44.77 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  44.77 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 220 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 224 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  44.77 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  43.51 
 
 		 227 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  41.91 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 220 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.21 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 221 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  45.19 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  40.49 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.12 
 
 		 227 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.39 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 220 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  43.11 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  43.11 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 282 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 223 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  44.77 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  45.76 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  44.77 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0139  DNA-binding response regulator  43.7 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315235  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  44.77 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  43.7 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 220 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  40.16 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  43.22 
 
 		 221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 252 aa  181  7e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 221 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 260 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.56 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  43.39 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2598  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.0460703 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3293  two component transcriptional regulator  40.59 
 
 		 221 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 220 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  41.8 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.6 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.39 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  41 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  43.15 
 
 		 224 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>