More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02110 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  85.36 
 
 		 279 aa  400  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  85.71 
 
 		 244 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  67.23 
 
 		 235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  66.81 
 
 		 242 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.76 
 
 		 220 aa  293  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  62.88 
 
 		 220 aa  285  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  63.32 
 
 		 220 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  63.32 
 
 		 224 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  62.88 
 
 		 225 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  63.32 
 
 		 220 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  63.32 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  63.32 
 
 		 224 aa  278  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  63 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  62.56 
 
 		 241 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 210 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  57.46 
 
 		 219 aa  259  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  55.7 
 
 		 219 aa  254  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.07 
 
 		 219 aa  251  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  55.65 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.3 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  48.48 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  48.47 
 
 		 223 aa  232  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 220 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  51.53 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  51.56 
 
 		 220 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 220 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  50.43 
 
 		 221 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  51.75 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 220 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1597  two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 224 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  52.19 
 
 		 223 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.5 
 
 		 224 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  51.98 
 
 		 220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1939  DNA-binding response regulator  55.61 
 
 		 221 aa  224  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.42 
 
 		 219 aa  224  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 219 aa  224  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  50.22 
 
 		 221 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  54.63 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  48.46 
 
 		 219 aa  222  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2624  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 239 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 227 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 220 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 221 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  51.23 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  48.48 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 		 221 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  52.84 
 
 		 221 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 220 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  51.27 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 224 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  46.76 
 
 		 225 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  46.76 
 
 		 225 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.79 
 
 		 219 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.93 
 
 		 219 aa  208  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.75 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3404  response regulator transcription regulator protein  52.84 
 
 		 221 aa  208  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  48.47 
 
 		 220 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.35 
 
 		 219 aa  208  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.78 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  51.11 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  50.42 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  47.58 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.35 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.9 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>