More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1696 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  100 
 
 
220 aa  434  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
220 aa  434  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 
220 aa  280  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  60.45 
 
 
221 aa  271  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  59.36 
 
 
220 aa  270  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  59.09 
 
 
221 aa  268  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  58.18 
 
 
225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  57.99 
 
 
221 aa  264  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  57.99 
 
 
221 aa  264  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  57.99 
 
 
221 aa  264  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.19 
 
 
221 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.19 
 
 
221 aa  260  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.88 
 
 
220 aa  254  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3404  response regulator transcription regulator protein  59.82 
 
 
221 aa  254  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  56.88 
 
 
220 aa  252  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2598  two component transcriptional regulator  59.36 
 
 
221 aa  250  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.0460703 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  60 
 
 
221 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.94 
 
 
227 aa  247  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 
220 aa  241  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  55.71 
 
 
225 aa  239  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  55.71 
 
 
220 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  54.79 
 
 
224 aa  237  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 
224 aa  234  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  54.34 
 
 
220 aa  234  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  54.34 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  54.34 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  54.34 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  54.34 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  54.34 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3110  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 
224 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.178244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
219 aa  231  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  50.92 
 
 
221 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  51.75 
 
 
246 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  53.92 
 
 
283 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 
219 aa  228  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  53.92 
 
 
241 aa  228  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 
219 aa  227  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3293  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 
221 aa  225  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 
242 aa  225  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.08 
 
 
218 aa  224  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4098  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.13 
 
 
219 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 
279 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4983  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.17 
 
 
218 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 
219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 
244 aa  221  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  53.59 
 
 
210 aa  221  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  50 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  50 
 
 
220 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 
235 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
220 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  48.61 
 
 
219 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  48.84 
 
 
220 aa  213  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  42.53 
 
 
232 aa  211  9e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  42.53 
 
 
223 aa  209  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  47.83 
 
 
225 aa  208  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  47.83 
 
 
225 aa  208  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.08 
 
 
224 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  50 
 
 
219 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 
221 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 
222 aa  205  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 
218 aa  204  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 
220 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  50.46 
 
 
255 aa  203  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  49.08 
 
 
228 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 
223 aa  203  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.33 
 
 
218 aa  202  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 
220 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 
220 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 
220 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  49.54 
 
 
220 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 
221 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 
220 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 
220 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 
220 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  50 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 
227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 
227 aa  198  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 
220 aa  198  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 
220 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.73 
 
 
221 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 
227 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 
219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 
220 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 
219 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.3 
 
 
219 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.75 
 
 
219 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 
235 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.73 
 
 
221 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.69 
 
 
220 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 
219 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 
219 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1597  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
224 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  45.41 
 
 
223 aa  192  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.83 
 
 
219 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>