More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4760 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3110  two component transcriptional regulator  84.75 
 
 		 224 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178244 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  61.75 
 
 		 221 aa  251  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  58.99 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  58.8 
 
 		 220 aa  248  7e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.94 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  56.94 
 
 		 220 aa  247  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4983  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.19 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  56.82 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  56.82 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  56.82 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3293  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4098  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.26 
 
 		 219 aa  234  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2598  two component transcriptional regulator  59.09 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.0460703 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  54.79 
 
 		 225 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.24 
 
 		 220 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 		 220 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.37 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.92 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3404  response regulator transcription regulator protein  57.27 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 219 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.93 
 
 		 219 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  58.53 
 
 		 221 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  54.38 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  54.38 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  54.38 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  54.38 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  54.38 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  53 
 
 		 225 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  53.46 
 
 		 220 aa  214  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  53.46 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  53.46 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  53.46 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  53.95 
 
 		 283 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 220 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  48.15 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.46 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  53.95 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 235 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.6 
 
 		 219 aa  207  8e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  45.41 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  47.22 
 
 		 219 aa  204  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  45.37 
 
 		 218 aa  204  8e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  44.95 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.15 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  51.94 
 
 		 210 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 223 aa  200  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 221 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.69 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  46.54 
 
 		 221 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1939  DNA-binding response regulator  53.67 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.36 
 
 		 219 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.15 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.15 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  46.36 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.36 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  46.36 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.36 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  46.53 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  46.53 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.36 
 
 		 219 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.36 
 
 		 219 aa  190  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  44.49 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2624  two component transcriptional regulator  44.6 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.3 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  47.71 
 
 		 223 aa  188  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  43.98 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  46.79 
 
 		 220 aa  188  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 		 220 aa  188  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  48.61 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  44.39 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.25 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 219 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  45.7 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>