More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3741 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  100 
 
 		 220 aa  440  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  100 
 
 		 220 aa  440  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  100 
 
 		 220 aa  440  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  73.85 
 
 		 220 aa  332  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0478  DNA-binding transcriptional regulator BasR  85.91 
 
 		 220 aa  320  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000375321  normal  0.853043 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0310  DNA-binding transcriptional regulator BasR  64.35 
 
 		 232 aa  300  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0214332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  63.43 
 
 		 222 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4016  DNA-binding transcriptional regulator BasR  65.74 
 
 		 222 aa  285  4e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  65.28 
 
 		 222 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.88 
 
 		 222 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4554  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.88 
 
 		 222 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4638  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.88 
 
 		 222 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4547  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.88 
 
 		 222 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4687  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.88 
 
 		 222 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.20519  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.42 
 
 		 222 aa  253  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  56.42 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.42 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.42 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  56.42 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.42 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.42 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  56.42 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  52.07 
 
 		 220 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 220 aa  215  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.15 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.13 
 
 		 220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.69 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 227 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.69 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  47.69 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.69 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 227 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.15 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.15 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  47.69 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.15 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.15 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.69 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.15 
 
 		 219 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 219 aa  211  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.69 
 
 		 219 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 218 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  51.83 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.22 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  46.98 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.86 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  51.38 
 
 		 220 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  51.61 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  44.86 
 
 		 219 aa  205  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  51.38 
 
 		 220 aa  204  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  51.38 
 
 		 220 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3490  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.22 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 225 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  52.53 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  47.2 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.13 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  44.24 
 
 		 218 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  43.24 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3935  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.646675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  48.13 
 
 		 220 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.47 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.73 
 
 		 218 aa  198  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  43.24 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 223 aa  197  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 221 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  47.2 
 
 		 227 aa  197  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  47.69 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  47.69 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0139  DNA-binding response regulator  48.85 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315235  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  45.41 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  46.31 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  46.31 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  48.11 
 
 		 283 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3990  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.300119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>