More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0124 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 220 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  90 
 
 		 220 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  88.18 
 
 		 220 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  70.51 
 
 		 219 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  71.36 
 
 		 220 aa  294  6e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4906  two component transcriptional regulator  73.27 
 
 		 219 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4359  two component transcriptional regulator  71.89 
 
 		 219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  63.89 
 
 		 220 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0471  two component transcriptional regulator  69.44 
 
 		 221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  60.65 
 
 		 220 aa  244  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  59.26 
 
 		 221 aa  241  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  59.26 
 
 		 220 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  57.01 
 
 		 221 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  57.01 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.76 
 
 		 220 aa  227  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 220 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  51.39 
 
 		 232 aa  220  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  56.22 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  56.22 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  56.22 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  56.22 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  56.22 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  50.93 
 
 		 223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  56.28 
 
 		 241 aa  218  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 219 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 227 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  53.28 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  55.81 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  54.84 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  54.84 
 
 		 224 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  54.84 
 
 		 220 aa  214  7e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  54.84 
 
 		 224 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  53.21 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 227 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  55.45 
 
 		 223 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.93 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 220 aa  211  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  53 
 
 		 222 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 220 aa  208  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.93 
 
 		 219 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  51.4 
 
 		 219 aa  207  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 228 aa  207  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 223 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  53.24 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  53.24 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.78 
 
 		 223 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 249 aa  204  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  52.78 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  53.62 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 		 220 aa  203  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  48.61 
 
 		 225 aa  202  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.6 
 
 		 219 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 227 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  48.15 
 
 		 219 aa  202  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.69 
 
 		 219 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.45 
 
 		 220 aa  202  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 220 aa  201  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3433  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.69 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3528  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.69 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3358  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.69 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3427  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.69 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  0.844658 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3362  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.69 
 
 		 219 aa  201  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  48.43 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.22 
 
 		 219 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  47.22 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.22 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  47.22 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  48.26 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  48.26 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  47.22 
 
 		 219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  46.36 
 
 		 220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  48.6 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  47.73 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.2 
 
 		 219 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2066  two component transcriptional regulator QseB  47.66 
 
 		 223 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 222 aa  198  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.76 
 
 		 219 aa  198  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  46.76 
 
 		 219 aa  197  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>