More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3148 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3148  two component response regulator  100 
 
 		 225 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.174373  hitchhiker  0.000575412 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  60.63 
 
 		 213 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  54.09 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  48.86 
 
 		 220 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  51.36 
 
 		 225 aa  200  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  51.14 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 219 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 219 aa  187  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.47 
 
 		 219 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  47 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  53.18 
 
 		 219 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  50.91 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  53.18 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 220 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  46.36 
 
 		 219 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  50.23 
 
 		 219 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  51.6 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.91 
 
 		 218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  41.23 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 221 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 218 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  45.25 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 235 aa  157  8e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 244 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1597  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 224 aa  157  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  45.62 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  45.62 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  45.62 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  45.62 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  45.62 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1866  two component transcriptional regulator  49.76 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.374926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.25 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.45 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  41.1 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  45.58 
 
 		 241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  45.58 
 
 		 283 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  43.84 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  38.74 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  44.29 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5521  two component response regulator  38.64 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.424584  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 224 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  39.09 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>