More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7369 on replicon NC_007488
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  72.15 
 
 		 219 aa  302  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  66.36 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 223 aa  295  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.75 
 
 		 223 aa  290  8e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  64.84 
 
 		 223 aa  284  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  64.35 
 
 		 219 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  61.11 
 
 		 221 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  61.57 
 
 		 221 aa  267  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  61.57 
 
 		 221 aa  267  8e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  65.28 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  59.72 
 
 		 219 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  59.26 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  56.02 
 
 		 220 aa  247  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  62.96 
 
 		 219 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  62.04 
 
 		 232 aa  242  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  62.04 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  62.04 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  62.04 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  62.04 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  62.04 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  62.04 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  60.19 
 
 		 219 aa  235  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  56.16 
 
 		 222 aa  234  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  59.26 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  51.16 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  48.87 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.07 
 
 		 219 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 224 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 235 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  52.29 
 
 		 219 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  47.03 
 
 		 233 aa  191  6e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 221 aa  191  7e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 227 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.13 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 220 aa  188  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  47.22 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  46.3 
 
 		 221 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 213 aa  185  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3148  two component response regulator  50.72 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.174373  hitchhiker  0.000575412 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4829  DNA-binding response regulator  44.95 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00101292  normal  0.0130353 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2754  two-component system response regulator  47.95 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.864218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  50.47 
 
 		 225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1337  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 249 aa  181  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.257065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 227 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  46.3 
 
 		 220 aa  181  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  46.82 
 
 		 224 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 279 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 244 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 220 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 220 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  48.6 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 226 aa  178  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 226 aa  178  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  49.53 
 
 		 220 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  43.93 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0471  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 223 aa  177  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  41.85 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4906  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 221 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.76 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  49.53 
 
 		 283 aa  175  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 252 aa  174  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 218 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 247 aa  174  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>