More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1287 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  100 
 
 
221 aa  442  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  99.55 
 
 
221 aa  439  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  81 
 
 
221 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  75 
 
 
219 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  68.06 
 
 
219 aa  288  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.81 
 
 
223 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  63.89 
 
 
225 aa  285  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  65.74 
 
 
219 aa  284  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  65.28 
 
 
219 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  67.59 
 
 
223 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  63.89 
 
 
223 aa  279  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  60.19 
 
 
220 aa  274  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  64.06 
 
 
220 aa  274  8e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  61.57 
 
 
219 aa  267  8e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  67.13 
 
 
219 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  65.9 
 
 
219 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  65.28 
 
 
232 aa  256  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  65.28 
 
 
219 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  65.28 
 
 
219 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  65.28 
 
 
219 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  65.28 
 
 
219 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  65.28 
 
 
219 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  65.28 
 
 
219 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  63.89 
 
 
219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  58.06 
 
 
222 aa  241  6e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  52.8 
 
 
220 aa  222  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.34 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  54.67 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  55.09 
 
 
218 aa  213  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  54.67 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  54.67 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  54.67 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  54.67 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 
225 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 
224 aa  210  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  53.74 
 
 
220 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  54.25 
 
 
283 aa  209  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.93 
 
 
219 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  52.07 
 
 
220 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  53.77 
 
 
241 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 
235 aa  208  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  51.87 
 
 
220 aa  207  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 
220 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  53.27 
 
 
224 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  51.6 
 
 
213 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 
219 aa  204  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  48.13 
 
 
219 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.62 
 
 
224 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  46.9 
 
 
246 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  48.4 
 
 
220 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  51.83 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  53.2 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 
230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  45.89 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 
279 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 
244 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 
220 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.66 
 
 
221 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  50 
 
 
219 aa  194  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.85 
 
 
219 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  45.98 
 
 
242 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.69 
 
 
220 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3148  two component response regulator  51.67 
 
 
225 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.174373  hitchhiker  0.000575412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 
255 aa  193  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  48.4 
 
 
221 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 
221 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.39 
 
 
226 aa  191  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 
226 aa  191  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 
223 aa  191  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0692  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 
224 aa  191  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.478389  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 
221 aa  191  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  48.15 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  48.15 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2076  OmpR family two-component transcriptional regulator  43.98 
 
 
224 aa  190  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000231542  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.2 
 
 
221 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  48.15 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  48.15 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  48.15 
 
 
220 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 
220 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  44.29 
 
 
232 aa  189  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  48.15 
 
 
220 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4906  two component transcriptional regulator  48.61 
 
 
219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293577  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 
220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.78 
 
 
220 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.78 
 
 
220 aa  189  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  46.08 
 
 
219 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  44.29 
 
 
223 aa  188  4e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.78 
 
 
220 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 
220 aa  188  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.39 
 
 
218 aa  188  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 
221 aa  188  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.91 
 
 
220 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 
222 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 
221 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2598  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 
221 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.0460703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1143  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
224 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.606905  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 
219 aa  185  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 
221 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  44.19 
 
 
221 aa  184  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>