More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2463 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6599  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000657401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1393  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.5 
 
 		 223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0533398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2217  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2516  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 223 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.492015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7229  two-component response regulator  44.55 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3715  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  42.86 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3516  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.796525  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  38.12 
 
 		 221 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2017  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.406269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2454  transcriptional regulator domain protein  38.39 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.02572  normal  0.811367 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4950  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2223  winged helix family two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 229 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.335669  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.56 
 
 		 225 aa  154  8e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3359  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0160  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4632  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.920872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 227 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1075  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.45 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.45 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  39.45 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0746  two component transcriptional regulator  39.55 
 
 		 256 aa  151  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5059  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2423  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.265311  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1533  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.649703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  42.2 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  42.2 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  42.2 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  42.2 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02407  two-component system regulatory protein  41.82 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  42.2 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  42.2 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  42.2 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1236  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 223 aa  149  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0933  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  38.99 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5339  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3910  two component transcriptional regulator  36.53 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.598174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4876  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.292661  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3120  two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  40.37 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0727  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  39.19 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3603  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3281  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3879  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0528  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BasS  38.64 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4578  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.64 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.800667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4353  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.64 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4667  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.64 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03945  hypothetical protein  38.64 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5626  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.64 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3914  DNA-binding transcriptional regulator BasR  38.64 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.730701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3617  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.18 
 
 		 220 aa  144  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000270917  normal  0.430126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0257  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  37.73 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  34.38 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  34.38 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0286  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 231 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  37.44 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4141  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>